新舊政權交接前夕，國安會諮詢委員、潛艦小組召集人黃曙光卻於2024年4月16日突然說已向總統蔡英文請辭，雖發出聲明指是個人身心俱疲，完全與他人無關，更無關任何政治因素，然而，離520沒剩多少時間，黃為什麼一定要在這個敏感時間點不如歸去？
據透露，這與總統蔡英文3月9日帶著準總統賴清德至台船祕密視導海鯤號時的一場談話有關，在那之後，開啟了接下來後續艦誰主浮沉的角力。當天，對於後續艦，蔡英文說，應交予賴清德決定，沒想到賴清德當場指示，「要做，就一次做完」。聽到準總統這樣發話，潛艦團隊當然興奮，但據指出，海軍司令唐華有其意見。
