菲律賓和中國因南海局勢而關係緊張，加上其總統小馬可仕恭賀我國副總統賴清德贏得總統大選，《日經亞洲》22日表示，此情況加大中國對台灣採取下一步行動，使東南亞國家在外交困境中面臨可能的始料未及後果的憂慮。新加坡南洋理工大學研究員許瑞麟直言：「東南亞最不想要的就是台灣有衝突。」
2023年2月，中國使用軍用雷射照前往仁愛暗沙的菲律賓海巡船，導致船員暫時失明，雙方的緊張關係加劇。同年12月，向黃岩島附近的菲律賓漁民運送人道物資，以及向擱淺在仁愛暗沙的登陸艦「馬德雷山號」（BRP Sierra Madre）進行補給的菲律賓艦艇遭中國海警噴射水柱。
我國總統暨國會大選13日落幕，執政的民主進步黨總統候選人賴清德勝出，而菲律賓外交部隔日強調，其承諾「一個中國」政策，並提到菲律賓和中國1975年6月所簽《聯合公報》明文，「雙方政府同意透過和平方式...... 不訴諸使用武力威脅來處理所有爭端」。
不過小馬可仕（Ferdinand Marcos Jr.）15日在原名「推特」（Twitter）的X平台寫道：「代表菲律賓人民，我恭賀總統當選人賴清德選上台灣下任總統。我們期待密切合作、強化共同利益、促進和平，以及為我們的人民確保未來繁榮。」賴清德隨後分享小馬可仕貼文，感謝他的祝賀。
《現代菲律賓政治的起源》作者江懷哲認為，小馬可仕2022年6月上台後，逐漸清晰的親美外交路線，加上近來南海緊張局勢，是小馬可仕祝賀賴清德贏得總統大選的背景脈絡。中國則相當不滿，其外交部發言人毛寧16日直批，小馬可仕應多讀書，部長助理農融也召見菲律賓駐華大使抗議。
中國對台恫嚇將衝擊東南亞
菲律賓國防部長特歐多洛（Gilbert Teodoro）17日回嗆，毛寧用低俗言語冒犯小馬可仕及菲律賓人民，只是貶低她自己、外交部和她所代表的政黨。《路透》當時稱，中國外交部與其駐菲律賓大使館沒有回應特歐多洛的發言。中國和菲律賓同日舉行南海問題雙邊磋商機制第8次會議。
該會議由農融和菲律賓外交部次長拉札洛（Theresa P. Lazaro）在中國上海進行，雙方同意任何情況要透過外交冷靜處理，對話對和平穩定局勢相當重要，並各自表達對仁愛暗沙的立場，保證互相致力於避免局勢加劇。中國的聲明稱菲律賓重申「一個中國」政策，菲律賓的聲明則隻字未提。
菲律賓駐美國大使羅慕德茲（Jose Manuel Romualdez）2023年12月接受《日經亞洲》專訪直言，南海已成「一觸即發的地點，而非台灣」。《日經亞洲》22日指出，儘管菲律賓和中國同意「提升」海事對話，觀察人士憂心，中國可能對台灣的進一步武力恫嚇，對東南亞有潛在的可怕經濟與安全後果。
