新冠（武漢）肺炎本土疫情嚴峻，嚴重衝擊，府院28日聯手撇清撤換中央疫情指揮中心指揮官傳聞，力挺衛福部長陳時中，也有信心在疫情似乎沒進一步惡化情況下，6月透過總統蔡英文親自帶頭打國產疫苗，及外購疫苗提前到位，兼紓困方案啟動，有機會化解民怨衝擊。不過，對比府院樂觀，綠營私下有更深憂心，不小聲音認為目前不論抗疫及紓困，都還在既有窠臼，更有能與聞機要者私下直言，蔡英文心態仍在防疫光芒最高時，還沒「歸零」。
某高層私下坦言，民怨很深，一年來的防疫光芒已破滅，本土疫情升溫，指揮中心一度有第一周便可能讓確診數下降的評估，但好消息沒有出現，確診數看似沒擴大，死亡數卻開始還緩步升高，陳時中光芒已破功，需要更大的加持。
疫情升溫，陳時中指揮官寶座也動搖，府院昨聯手替陳時中指揮官背書，撇清要以前副總統陳建仁取而代之的說法。惟據了解，陳時中是勉力奮戰，但衛福部內也有文官窠臼，陳指揮官頭銜看似職權無限大，且不提有志2024總統大選的雙北白藍首長柯文哲、侯友宜頻頻明槍暗箭，執政團隊內部就有不少掣肘。
衛福部擬借用北市國軍英雄館，遭國防部長嗆聲
疫情升溫，衛福部要徵召各機關處所做檢疫所、防疫旅館，及醫療資源調撥，國防部、退輔會、經濟部下國營事業、教育部都有消極甚至公開抵制作為。最典型如國防部長邱國正，竟然反對衛福部擬借用北市國軍英雄館主張，甚還嗆「動用英雄館，未免『柿子挑軟的捏』」，陳時中也只能向蘇貞昌、蔡英文求援，請高層長官來排解。
某旁觀高層坦言，很多事都超過陳時中能處理範圍，各機關本位主義非常嚴重，軍方系統尤其囂張，這也只有擁有統帥權的總統下來才能處理，對比當年SARS，前總統陳水扁跳下來動員軍醫支援，此時狀況，會讓有那段經驗的人更懷念扁。
此外，雙北醫療負荷，幾間大的私立醫療機構配合度都大有問題，陳時中牙醫背景，又只能倚賴衛福部官僚，總不想為難下屬的陳時中，很多事都只靠自己處理，但他能量真的有限。
柯文哲、侯友宜兩雙北在野黨首長不只常給陳時中出招，更在封城議題上頻挑戰行政院長蘇貞昌底線。考量經濟衝擊，蘇貞昌態度是絕不封城。
英系對紓困方案有意見 黨內攪動反蘇情緒
但因行政院日前提出的紓困方案，為了是否更大規模的發現金，黨內英系、跨黨派跨派系太陽花世代各地市議員都有串連動作，認為蘇內閣提出的紓困方案還不夠，主張在排富基礎下，比照美國前總統川普（Donald Trump）作為，更全面「發現金」。蘇內閣評估是即使仍有不少舉債空間，還是要有財政紀律的顧慮，不想有更高的舉債，也認為新推出的給家長1萬元照護補助，已很能滿足民意期待。
據了解，蘇內閣視這些雜音，主要是平日就不懷好意的英系動作，但其實黨內連被視為蘇友軍的新系，周春米、何欣純都在黨團群組表態支持，跨派系呼應者大有人在，認為蘇內閣的紓困，還停留在去年的框架，相關議論，讓黨內本就盛大的反蘇情緒更攪動。 （相關報導： 中國不作梗，台灣就能買到疫苗？新加坡搶疫苗策略曝光，光靠有錢還不夠 ｜ 更多文章 ）
陳建仁近日公開態度，顯示對疫情爆發有「異」見
府院聯手澄清要以陳建仁換陳時中，不過，被視為潛在救援的陳建仁，確實開始有公開角色，除了出現在蔡英文臉書，被強調仍在團隊內，28日也現身民視專訪，替蔡政府寄予厚望的國產疫苗背書。不過，陳建仁近日公開態度，也看出對疫情爆發有「異」見，例如陳建仁對外媒坦言疏於風月場所管制，也透過臉書分享學生〈如何快速重建流行曲線與指揮中心公信力/從校正回歸之亂談起〉文章，對「校正回歸」有異見。
