新冠（武漢）肺炎本土疫情嚴峻，嚴重衝擊，府院28日聯手撇清撤換中央疫情指揮中心指揮官傳聞，力挺衛福部長陳時中，也有信心在疫情似乎沒進一步惡化情況下，6月透過總統蔡英文親自帶頭打國產疫苗，及外購疫苗提前到位，兼紓困方案啟動，有機會化解民怨衝擊。不過，對比府院樂觀，綠營私下有更深憂心，不小聲音認為目前不論抗疫及紓困，都還在既有窠臼，更有能與聞機要者私下直言，蔡英文心態仍在防疫光芒最高時，還沒「歸零」。
某高層私下坦言，民怨很深，一年來的防疫光芒已破滅，本土疫情升溫，指揮中心一度有第一周便可能讓確診數下降的評估，但好消息沒有出現，確診數看似沒擴大，死亡數卻開始還緩步升高，陳時中光芒已破功，需要更大的加持。
疫情升溫，陳時中指揮官寶座也動搖，府院昨聯手替陳時中指揮官背書，撇清要以前副總統陳建仁取而代之的說法。惟據了解，陳時中是勉力奮戰，但衛福部內也有文官窠臼，陳指揮官頭銜看似職權無限大，且不提有志2024總統大選的雙北白藍首長柯文哲、侯友宜頻頻明槍暗箭，執政團隊內部就有不少掣肘。
