「自由經濟示範區」送進立法院審查後風波不斷，從名稱到內涵，立委都有意見。日前經濟委員會初審示範區條例，在野黨立委還把名稱改為「中華民國策略經濟發展區」，雖然還沒最後定案，但也凸顯在野黨對示範區的態度。民進黨擔心，示範區對台灣經濟體質不但沒有幫助，還會掏空台灣產業。
自由經濟示範區是馬政府黃金十年的一環，以自由化、國際化與前瞻性為核心理念，大幅鬆綁物流、人流、金流限制，落實市場開放，並發展智慧運籌、國際醫療及農業加值等具高附加價值的產業，希望透過示範區，營造我國參與區域經貿組織的條件，並吸引國內外投資，創造就業，為我國經濟成長注入新動能。
為了爭取朝野立委和民間支持，國發會很賣力，不但連開了5場公聽會，還分別在北、中、南地區舉辦多場說明會。立院公聽會後，國發會更主動針對土地徵收、環評、野生動物保育及農業加值等4大爭議，協調跨部會修正相關條文；包括未來示範區土地取得將排除徵收與區段徵收、外國貨主內銷10%免稅要排除農產品適用等。
雖然外界對自由經濟示範區的設計多有疑慮，但國發員會主委管中閔強調，台灣經濟最近很悶，希望透過示範區引進新的經濟動能，透過開放讓經濟更加自由化；而自由經濟示範區是台灣經濟自由化、國際化的一部分，也是和中國競爭的利器，抵制示範區，等於是幫中國大陸大忙。
不過，民進黨立委管碧玲認為，自由經濟示範區對台灣經濟體質或經濟成果普遍分享都沒有幫助，相反的會有掏空產業的危機；以國際醫療專區為例，等於是把醫療體制作根本性的推翻，從財團法人變成公司組織，從專業組織變成營利組織，會把優秀醫療專業人才磁吸進區內，專區變成國外權貴的醫療後花園。
管碧玲表示，自由經濟示範區的設計很像自由貿易港，實施後完全沒效應、招不到商。她強調，更改示範區的名稱是一個啟發的概念，與其要有策略性產業出來，不如弄清楚策略性產業如何發展，「改名是在揭櫫一種對的方向」，當然新的名稱和原來的條文內容方向不一樣。
對於在野黨的疑慮，國發會產業發展處長詹方冠表示，示範區會引進外籍醫事人員，不會影響國內醫療人力；農業加值部分也不會衝擊國內生態與農業，他舉例說，原先保育類野生動物活體輸出入已限縮為「觀賞水族動物」，且進口的觀賞水族動物未經農委會同意，也不得流出示範區。此外，加工後的管制性大陸產品如果仍屬管制品，需全數外銷，不得流入國內市場。
至於示範區審查未來的走向，管碧玲認為，一方面要看國民黨的決心有多強，以及能不能聽得進反對的意見；另一方面則要看新任民進黨主席蔡英文上台後的態度，「小英應該很快會有態度」，而民進黨也要趁此機會加強在經濟政策方面的論述，提出可行的方向引導政府政策。
