在817萬餘票的餘威中，蔡英文於5月20日正式展開第二任的總統任期。在蔡英文就職演說中外界極為關注的兩岸關係部分，除了再次重申1月11日勝選之夜所提之「和平、對等、民主、對話」八字箴言外，也強調絕不接受「一國兩制」、矮化台灣與任何破壞現狀的做法，同時她也再度表示，未來在處理兩岸事務問題上，仍會依循《中華民國憲法》與《兩岸人民關係條例》，目標是維持台海和平穩定。
然而，細究其講話內容，除了字數與2016年相比明顯減少外，今次演說的整體立場相對強硬；再加上2016年演說中未提國防、兩岸的部分還獨立出來談，這次卻將兩岸放進「國家安全」領域，且先談國防、軍備發展再談兩岸。更令外界關注的是，蔡英文稱將於立法院組織「修憲委員會」，雖其重點是在台灣的內政與政府體制改革，但難保不會有擦槍走火之舉發生，一旦再發生諸如民進黨立委蔡易餘提案刪除《憲法》與《兩岸人民關係條例》中「國家統一前」字句的插曲，後果難以設想。由演說內容與事後北京的反應觀之，未來四年的兩岸關係，恐仍將會是在惴惴不安的氛圍中度過。
四年過去 蔡英文有何不同？
回顧蔡英文2016年就職演說對兩岸關係的著墨，當時的原文是這麼說的：「兩岸之間的對話與溝通，我們也將努力維持現有的機制。1992年兩岸兩會秉持相互諒解、求同存異的政治思維，進行溝通協商，達成若干的共同認知與諒解，我尊重這個歷史事實」。
「1992年之後，20多年來雙方交流、協商所累積形成的現狀與成果，兩岸都應該共同珍惜與維護，並在這個既有的事實與政治基礎上，持續推動兩岸關係和平穩定發展；新政府會依據中華民國憲法、兩岸人民關係條例及其他相關法律，處理兩岸事務。兩岸的兩個執政黨應該要放下歷史包袱，展開良性對話，造福兩岸人民」。
那時，最受兩岸各界熱議的，是蔡英文總結出幾個兩岸關係的關鍵元素。首先，她打破過往民進黨的自我設限，說出「1992年兩岸兩會會談的歷史事實與求同存異的共同認知，這是歷史事實」；再者，她強調「中華民國現行憲政體制」；同時也提到兩岸多年來的協商和交流互動成果；最後，不免俗地論及台灣的民主原則及普遍民意。
然而，與2016年的論述相比，今年的就職演說中，蔡英文透露出幾點不一樣的玄機。其一，上回演說，蔡英文通篇未提「國家安全」；此次不但新增「國家安全」一篇，還將「兩岸和平」放在該篇之內，並置於「國防改革」與「參與國際」之後，引起外界高度關注。
事實上，自2019年初習近平在《告台灣同胞書》40週年紀念會上提出「習五點」後，蔡英文就撿到一把大槍，藉此挽回低迷的個人聲勢，加以稍晚開展的香港「反修例」運動又提供了充足子彈，使蔡英文狂打「反中反共牌」，不但擊潰黨內初選對手賴清德、更在總統大選大獲全勝。
