2003年SARS疫情肆虐，當時抗煞總指揮李明亮請中研院院長李遠哲幫忙，希望國安單位能協助抗疫。李遠哲於是向國安會秘書長康寧祥請求支援。李登輝時代訓練出來的國安幕僚張榮豐、劉湘濱與賴幸媛等人進駐疾管局，以軍事作戰指揮中心模式，協助建立疫情指揮中心。
SARS之後，現任副總統、時任衛生署長陳建仁與將接疾管局長的郭旭崧赴美取經，學習美國衛生部的部長指揮中心（SCC），花了1億元在疾管局打造指揮中心。同時引進美國公共衛生服務軍官團（PHSCC），也就是第7軍種，建立台灣的防疫醫生團隊。這支防疫醫生隊伍日後到海外四處征戰、調查疫情，成為台灣防疫工作重要尖兵。
從SARS至今17年，台灣防疫指揮體系逐漸健全，也形成一套較成熟的作業模式，讓防疫指揮官陳時中能穩健指揮，也讓台灣在武漢肺炎疫情中有傑出表現，受全球矚目。
到底這17年來，這支防疫團隊是怎麼一步步成長茁壯？
中央流行疫情指揮中心每天下午兩點的記者會，是目前全台收視率最高的節目。這個超強指揮中心有如全台灣民眾在疫情風浪中的燈塔。
指揮官陳時中每天在鏡頭前就是在傳達三個訊息：「有我在、看我做、跟我來」。「有我在」是表現政府面對危機時要讓民眾安心；「看我做」為提出有效辦法，讓民眾願意跟進；「跟我來」傳達政府與人民同舟共濟的決心。
李明亮請託李遠哲找上康寧祥
美國總統川普（Donald Trump）也每天舉行例行記者會，他自稱現在是個「戰爭時期的總統」，抗疫如作戰。其實，台灣的防疫指揮中心，也是仿自軍事作戰指揮中心，最早是由李登輝總統時代訓練出來的國安幕僚幫忙建立的。
二○○三年ＳＡＲＳ疫情肆虐，當時抗煞總指揮李明亮請中研院院長李遠哲幫忙。李遠哲於是打電話給國安會秘書長康寧祥，希望指派有危機處理經驗的人員支援，在疾病管制局（ＣＤＣ，現升格為疾管署）開設危機指揮中心。
康寧祥立刻指派有處理一九九六年台海危機經驗的國安會副秘書長張榮豐、擔任過衛戍師指揮官、帶領團隊發展出玉山兵推系統的國安會秘書處處長劉湘濱，以及具國際談判經驗的國安會諮詢委員賴幸媛三人前去支援。現任國安會指派擔任疫情指揮中心窗口的國安會諮詢委員郭臨伍，當時擔任張榮豐秘書，也參與了指揮中心從無到有的建構。
這個團隊是李登輝時代訓練出來的國安幕僚，二○○○年政權轉移後被總統陳水扁留用。李任內的國安會曾被美國國安會譽為亞洲第一國安會。
目前為陽明大學校長，曾擔任疾管局局長、署長的郭旭崧接受《新新聞》專訪時，證實張榮豐等國安會高手的祕密進駐。
郭旭崧說，ＳＡＲＳ期間就臨時在地下一樓，也就是現在新聞發布室成立指揮中心，張榮豐等人也入駐。「我們受到他很大的影響，在防疫視同作戰、危機處理時的情報作戰部署、怎麼做檢討、如何寫作戰日誌等，這一整套跟他學了很多。」
張榮豐等人也以戰時指揮官的戰情指揮中心形式，規畫危機指揮中心配制，分為戰情室、輿情蒐集室、對策組與指揮組。 （相關報導： 就算戴口罩，也要隔這麼遠！疫情指揮中心公佈最新標準 ｜ 更多文章 ）
學會無顧忌拉警報與變換隊形
「一般機構管帳的不管錢。」郭旭崧說，張榮豐非常強調這個觀念，同樣的，「管情報的不能管作戰。」把這個概念應用到ＣＤＣ，「就是拉警報的人不能跟作戰合在一起，這是很大的改變。」
