機場捷運通車後，單程票基本票價最低30元、最高160元，另外也規劃「通勤369定期優惠票」和「135團體定期優惠票」等方案，讓沿線通勤族享有5至7折的票價優惠。不過多位議員在市長鄭文燦施政報告時指出，民眾認為機場捷運票價仍然過高，建議發行量大的桃園市民卡能納入補助方案，或考量多種方式，提供優惠票價。
市議員葉明月認為，捷運票價以135專案團體票來說，300人以上打5折，門檻仍然高。有民眾想要得到五折優待價，卻不曉得到哪籌措。
市議員陳美梅說，北捷、高捷持悠遊卡、一卡通有85折優惠，桃捷也應該跟進；長輩反應敬老愛心卡的800點只能搭公車，火車、捷運都不能搭，應考慮其他方式讓吸引長輩搭乘，或規劃轉乘公車優惠提升搭乘率。
增加接駁公車路線 提高轉乘公車優惠
市議員黃婉如說，民眾喜愛搭乘捷運棕線先導公車，到了新莊、迴龍，往台北就海闊天空了…桃園市民搭捷運卻要到中壢、長庚。建議其他捷運路線蓋成以前，先增加接駁公車，把桃園上班族拉到長庚搭機捷，提升使用率。
市議員彭俊豪建議，可再考慮推出1日票、2日票，配合YOUBIKE、接駁巴士提供家庭套票，刺激旅遊觀光。
市議員王浩宇則說，國外友人體驗過後都認為機捷票價真的「超便宜」，他認為在於悠遊卡部分應給予優惠，但是單程票部分可以考量虧損，提高單程票價上限。
營運滿一年後看盈虧情況做決定
市長鄭文燦說，捷運票價牽涉到費率審議，現行票價已滿足絕大多數通勤族需求，若再加碼優惠，機捷負擔會更重，且實際上賠錢的機會還是較大。不過，未來會研究電子票證可能性研擬，在營運滿一年後看盈虧情況做決定。
鄭文燦說，敬老愛心卡所有縣市都沒有跟台鐵連線，捷運《大眾捷運法》已提供長者乘車優惠，目前機場捷運電子票證系統還有驗票設備程式開發、票卡資訊交換作業及查核機制等項目有待持續更新，市府後續也將由桃捷公司在培養運量及成本考量的前提下，研議桃園市市民卡的優惠方案。
至於轉乘優惠部分，市府已與交通部及環保署協調，未來可能以空污基金部分補貼方式，提供機場捷運轉乘公車優惠。 （相關報導： 逃離都市不必跑很遠！盤點北部13處美又超舒服的好去處，在地人都不一定知道啊 ｜ 更多文章 ）
單程票價提高部份，鄭文燦說，經過「桃園市大眾捷運系統票價審議委員會」審議後，機場捷運單程票價最低30元、最高160元，介於高鐵和國道客運之間，具有競爭力。而由於機場捷運除為機場聯外交通，也是北北桃重要通勤工具，若要提高單程票價上限，還需審慎評估，目前還不適合納入考慮。
