本屆APEC年會在北京舉行，是我國領袖代表首次成功出席中國主辦的年會。然而不同於其他與會國利用年會現場舉行記者會等公開活動，台灣代表團不僅未規劃在會場舉行任何記者會，連在形同代表團主場的領袖下榻飯店舉行記者會，外交部國傳司都配合中方要求限制記者人數，更以事先報名制控管與會記者。
對照2001年APEC年會在上海舉行，台灣因人選問題最終無法與會，我方對今年的北京APEC懷有極高期待，也因此在代表團行程活動、媒體採訪等方面，格外配合中方限制。
在代表團出發之前，外交部已事先通知台灣記者，中國外交部對會場人數限制十分嚴格，所有場次採訪都有人數限制，並且必須事先報名。雖然我方的官員吹風會、部長記者會，多在代表團下榻的飯店舉行，但外交部仍堅持中方對所有與會國都有同樣規定，要求有意採訪的記者事前報名。
例如領袖代表、前副總統蕭萬長8日抵達北京下榻飯店時，有意採訪的台灣媒體卻在事前就被告知名額有限，必須事先報名，並將名單提交給中國政府。
儘管是台灣代表團的主場，且記者進入飯店已有嚴格安檢，也都持有APEC大會發給的記者證，8日現場仍發生中方維安人員當著我方外交部官員的面，逐一盤查台灣記者證件，並且趕走未列在事前提交名單上的台灣記者。
而隨後台灣代表團在飯店舉行雙部長會議後記者會，雖然外交部事前宣稱開放採訪，且歡迎國際媒體，但在記者會開始前，竟有中方維安人員在會場宣佈核對事先提報之名單，並高聲表示「沒有大會採訪證、不在名單上的記者一律離場」。
現場台灣記者質疑此舉違反外交部事前的宣佈，在場的外交部國傳司負責人竟出面要求台灣記者「配合」；對於輾轉才得知台灣代表團活動而趕來的香港記者，也強硬表示「沒有事先報名就不行」。
在隨後的記者會上，台灣媒體向代表團發言人杜紫軍提出質疑，杜紫軍先是推稱相關安排由外交部國傳司負責，他不了解細節，其後又說我方記者會完全對外公開，相信外交部也告知採訪年會的國際媒體。
事實上，現場就有外國媒體是在四處探聽台灣代表團行程，最終才從台北輾轉得知消息，並在外交部向中方維安人員斡旋請託下才得以進場。
對於我方記者會為何不在會場新聞中心舉行，以及為何未向各國媒體公告等疑問，杜紫軍竟又聲稱在下榻飯店舉行記者會「環境較好也比較正式」，而兩天來他在會場「並沒有看到有任何國家舉行記者會」。
然而年會開始兩天以來，已陸續有美、日和WTO等國家及組織在大會新聞中心舉行記者會，不但透過大會公告，而且完全對會議記者開放，無所謂限制人數的規定，更沒有因為維安考量而必須事先報名的作法。台灣外交部人員所稱的中方規定、維安考量等說法，顯然並未對其他成員國適用。
