從此外蒙就跟著蘇聯的腳步走了，跟中國再也不發生太大關係。中國也在大時代的混亂下艱難地經歷內戰、軍閥割據、日軍入侵、國共內戰等等，根本沒精力也沒資源去管外蒙事務，只剩名義上還沒有完全放棄而已。
1939年蘇聯紅軍、蒙古人民軍在蒙古東部的哈剌河谷與日本關東軍及滿洲國軍隊發生戰鬥（諾門罕事件），蘇蒙方裝甲部隊犀利，結果以日軍全敗作收。
1945年雅爾達密約-英美慷中國之慨
1945年2月11日，同盟國為爭取蘇聯加入對日本作戰的行列，在未通知中國政府的情況下與蘇聯簽署雅爾達密約，約中涉及將外蒙古、旅順、大連、東北新疆等中國權益通通讓渡給蘇聯，以之成為吸引蘇聯出兵日本的籌碼。中華民國再一次被英國與美國賣了。
1945年6月至8月，在二戰即將結束的最後日子，蔣委員長派了行政院長宋子文、外交部長王世杰、駐俄大使傅秉常與蔣經國赴莫斯科與史達林交涉中蘇友好同盟條約之建立，為了讓蘇聯即早出兵解決日本問題，中方代表費盡唇舌、百般委屈禮讓，但還是無法改變史達林堅定要讓外蒙獨立的意志。
我們可以從1945年7月3日，宋子文從莫斯科電報蔣中正委員長有關宋與史達林談外蒙古問題之談話內容：
「渝。密、極密。主席鈞鑒。今晚八時偕胡次長、傅大使及經國，同謁史太林談，談話三小時半，茲謹將談話詳細情形電陳、敬乞鑒核。
本日談話時，對東三省比較滿意，外蒙問題則成僵局，（一）史謂外蒙人民不願受中國政府統治，希望獨立，故盼中國承認外蒙現狀，蘇聯不欲併吞外蒙，亦盼中國准許外蒙脫離，職謂，蘇聯曾屢次承認外蒙為中國領土，史謂，然，但現為蘇聯國防關係，不得不在外蒙駐兵，並出以地圖示職，謂如有敵人由外蒙攻西伯利亞，西伯利亞必不守，以往日本曾試由外蒙攻西一次（指1939年諾門罕事件），故盼外蒙能獨立並與蘇同盟，保障蘇聯領土，職謂中國政府目前可不向蘇提商外蒙問題，盼史亦不提此難題，因中國任何政府如喪失土地完整，必為國人不諒。
史聞言謂如此吾人不能有任何協定，職謂史曾屢言欲維持中國統一，倘如此辦法，中國人民對政府將無信仰，且恐影響西藏問題，至此，史沉思片刻，繼謂可訂一秘密條約，俟日人戰敗後再公布，職謂蘇聯對中國向來友好，13年蘇聯首先廢棄在華特權，而有今日各國取消不平等條約。頃史謂旅順可不用租借方式，即顧念中國政府地位，盼對外蒙亦能重加考慮。史仍堅持其主張，此事究應如何處理，有何較好解決方法，乞鈞奪迅賜電示！」
史太林統帥與宋院長第二次談話記錄
出席人員：
史太林統帥、莫洛托夫外長、彼得羅夫大使、洛索夫斯基次長、柏巫洛夫翻譯
宋院長、傅大使秉常、胡次長世澤、蔣經國先生
時間：1945年7月2日下午8時至10時半
史太林統帥（以下簡稱史）詢宋院長是否知悉羅斯福總統邱吉爾首相及史太林所簽關於日本之文件（註指雅爾達會議決議案）旋將文件原本送宋院長閱看。
