賴清德「深入敵營」放火，會造成什麼效應尚不得而知，但有人認為，賴清德在大陸的表現，可能會影響往後綠營人物到大陸的訪問。新潮流系現任召集人、民進黨桃園縣黨部主委鄭文燦指出，這有待時間驗證，但整體來說，賴清德坦率直言，北京對台灣刺耳的聲音，要學習忍受，試著聽得進去。
由於大陸方面刻意封鎖消息，網路對賴清德宣揚台獨部分報道不多，純粹只是「出口轉內銷」，在台灣引起的反應比大陸大得多，多數台灣民眾對賴抱持肯定態度，認為他替台灣發聲，言人所不敢言。一位網友指出：「賴清德的表現剛剛好，是當前台灣檯面上政治人物應該學習的榜樣。」
針對賴清德在大陸談台獨，大陸國台辦趕緊滅火，國台辦十一日例行記者會，有記者問到賴清德在上海參訪的時候提到「台獨」稱「台灣的前途由二千三百萬人民共同決定」，國台辦發言人范麗青回應指出，大陸和台灣儘管尚未統一，但中國的主權和領土完整沒有分裂，兩岸同屬一個中國的事實從未改變。任何涉及中國主權和領土完整的問題，須由「全中國人民」共同決定。范麗青說：「我們對民進黨的政策是明確的、一貫的，我們反對台獨分裂圖謀的立場是堅定的、不可動搖的。」對此，總統府發言人馬瑋國表示，政府一向堅持在中華民國憲法架構下，由台灣兩千三百萬人民共同決定台灣的未來。
幾年前，台南一度是大陸遊客的紅燈警示區。零八年大陸海協會副會長張銘清來台訪問，在台南孔廟參訪時，遭到群眾包圍抗議，在混亂中，張被推倒，眼鏡掉落，衣服沾滿泥土，腰部挫傷，抗議民眾並包圍座車，還有人跳上車頂猛踹，也有民眾欲以旗杆敲打車窗。此事件後，大陸觀光團環台行程大多刻意跳過台南，造成當地觀光產業嚴重受挫。
作風務實推廣台南
賴清德接任台南市長後，作風務實，不是不講道理的死硬派。去年七月華航開辦台南香港直飛航線，賴清德率團首發，前往香港進行城市行銷，並舉辦三場展售活動，推廣台南觀光旅遊、農特產品、醫療產業，打響台南城市知名度，也讓他躍上國際舞台，當時他就說有機會一定到大陸訪問。
台灣的雙十國慶向來只有國民黨在慶祝，民進黨從不當一回事，台南市卻是個例外，從二零一零年賴清德上台以來，年年都在當天舉辦升旗典禮，是台灣六個綠營執政縣市中，唯一辦理國慶升旗典禮的縣市，賴清德展現出跟其他綠營縣市長不同的思維。
但賴清德可不是乖乖牌，面對國民黨的大一統教育，他絕不買單。教育部月前修正高中教科書課綱「微調」，遭到本土派極力反對。賴清德宣布，台南市政府已經要求所轄的四所完全中學的歷史課本，必須繼續沿用現行課綱之教科書，不會隨之起舞，不會接受教育部新修訂的課綱，因為新課綱違反現實，將台灣的主權及於中國，他反對這種洗腦教育。
