台南市新聞處長趙卿惠轉述說，復旦大學座談時，該校教授姜義華表示，民進黨因為有「台獨黨綱」，導致無法順利推動兩岸關係，其實兩岸過去並不是沒有交流，但雙方對這部分都沒有理解，需要共同正視。
面對台獨議題，賴清德並未閃躲，選擇正面回應。他直言，民進黨的台獨黨綱不是民共交流的障礙，若把焦點放在是否廢止台獨黨綱，就不了解台灣社會是先有台獨，才有民進黨。他所要表達的是台獨訴求有其社會基礎，重點是台灣社會有一個很重要的「民主共識」，就是台灣前途尊重二千三百萬人的決定，「固然台獨是民進黨主張，但程序上尊重台灣人民決定」。賴清德在大陸放膽高論台獨等議題，在台灣廣受矚目。
習醫的賴清德，在為病患下藥前，一定要先診斷，診斷後要證明這個藥有效。他之前接受亞洲週刊訪問表示，實證科學的訓練幫助他的邏輯思考更清楚，從政也一樣，發言必定有憑有據。但大陸方面可能不會滿意他對台獨所給的答案，甚至會很刺耳，覺得來者不善、存心挑釁。
稱許復旦學生參與六四
除台獨議題外，賴清德更主動觸及大陸最敏感的六四學運。他在會中表示，一九八九年在中共總書記胡耀邦去世之後的學運（六四學運），復旦大學學生有所響應，總計有四百多個教授連署，建議政府定位為學生愛國運動，並支持言論自由。他稱許復旦大學不僅是國家人才培育的搖籃，也是民主自由孕育的中心。隨後話鋒一轉，不忘自我推銷說，最近甫落幕的台灣的太陽花也是學生運動，代表人物林飛帆也是成功大學畢業的台南人，更見證台南多元自由民主的風氣。
賴清德也對台灣近二十年來的民主演進，做了扼要闡述。他指出，很多人不解台灣政府為何容許太陽花學運佔領立法院二十三天之久，又能和平落幕，他認為，主要是台灣社會經歷過二二八事件、美麗島事件等慘痛教訓，台灣人民前仆後繼投入民主改革運動，社會經過數十年的反省，政府認錯道歉、正式立法、賠償受害者；一九九零年野百合學運後，結束「萬年國會」運作，落實總統民選；台灣從歷史的經驗中學習、檢討，因此，社會對太陽花學運學生的訴求高度認同，願意以包容角度，容納各種不同的聲音。
在座談會上，被問到對兩岸交流的看法時，賴清德表示，民進黨主張積極參與兩岸交流，增進兩岸人民的福祉，如同習近平主席訪美時所提出「不衝突、不對抗、相互尊重、合作共贏」原則，應該也是未來兩岸交流的重要原則。
賴清德也呼籲大陸應多聽不同聲音，當前兩岸交流比以往頻繁，但台灣社會的疑慮反而加深，就是因為只聽到單一的聲音。這番暗指大陸只和國民黨交流的談話，可能讓大陸當局點滴在心頭。
