針對新冠肺炎（武漢肺炎）疫苗寄存各縣市一事，中央流行疫情指揮中心今(13)日晚間就「第二類『中央政府防疫人員』及第三類『高接觸風險第一線工作人員』疫苗量，寄放於各縣市」一事，發佈新聞稿進行說明。指揮中心表示，是以造冊名單核估各縣市第一類至第三類人員疫苗分配數量，包括前一批COVAX分配之的40.98萬劑及日本政府提供的124萬劑AstraZeneca新冠肺炎（武漢肺炎）疫苗，均以此原則估算。
歷次分配疫苗，中央都有「寄放」地方之舉，例如這一波AZ疫苗高雄表面上拿到9萬多，位居第一名，但疫情中心立即解釋，其中有1萬劑是代軍方領的；另外，台北市長柯文哲之前就解釋，中央寄放800瓶疫苗在台北，這些疫苗的施打速度並非北市能掌控，而這波發放的AZ疫苗，台北表面上領了7萬劑，但柯文哲表示，其中1萬2千劑實為中央所寄放，所以台北這次只實領到5萬8千劑。
指揮中心表示，對於符合各類接種對象身分者，新冠肺炎（武漢肺炎）合約醫療院所均不得以任何方式拒絕及妨礙該等對象接種，惟未限定須為其保留疫苗數量，故無所謂「寄放」的問題，如未及時接種，地方政府可依現行優先接種對象，安排接種作業。
指揮中心表示，考量先前第二類、第三類對象之接種作業，有些地方政府以各縣市所屬機關人員優先接種，而拒絕為符合第二類之「中央政府防疫人員」接種，本次疫苗分配時，特別提醒各地方政府衛生局，應提供工作地點位於該縣市的「中央政府防疫人員」及「高接觸風險第一線工作人員」接種疫苗。該數量是以機關或工作所在地位於該縣市，且尚未接種人數的6成估算，提供各地方政府參考使用。
指揮中心再次重申，配送予各地方政府的疫苗數量，是以疫情狀況、疫苗可分配數量、接種情形等綜合評估後，訂定分配數計算基礎之公式，對各縣市依比例公平分配，也會根據各自縣市之疫情及後續接種情形等狀況分析，滾動檢討並加強配送作業，全力協助地方政府推動疫苗接種作業。
