台大醫院唯一專門醫治處理心律不整的心導管室自今年端午節6月2日遭院長黃冠棠親自下令封鎖關閉至今，長達4個月，至今仍未恢復使用，對病患進行燒灼手術、心臟節律器植入等治療造成影響，恐增加病患醫療風險，立委周倪安質疑黃冠棠逕行將台大心導管室封鎖作法，枉顧病患權益，明顯是破壞經公開採購且驗收的政府公物，已有違法之虞。
知情人士指出，今年6月2日端午節休假傍晚，台大醫院院長黃冠棠帶著副院長、多位一級主管、資訊室人員及心導管室主任高憲立大隊人馬浩浩蕩蕩直驅台大醫院5樓手術無菌管制區的心臟心導管室，該間心導管室是台大醫院中唯一處理心律不整病症者，黃冠棠緊接著帶著人員進入X光主機機房，直接拔除機房裡的「多頻道心臟電生理紀錄分析儀」正連接中的網路線，該台儀器是台大醫院辦理的政府採購標案，甫於去年11月底完成驗收使用。
該知情人士進一步表示，整起事件處理過程，心導管室上級單位心血管中心主任林俊立從頭至尾未被告知並通知到場，而是黃冠棠以醫院院長身分到場越俎代庖下令處理，隨後黃冠棠更親自封鎖該心臟導管室機房至今，已逾4個月，仍未重新開啟使用。台大醫院也在今年7月31日發布人事令，宣布解除心血管中心主任林俊立職務。
立委周倪安10月6日針對台大醫院院長黃冠棠關閉心導管室長達4個月一事質詢，黃冠棠說法數變，先否認在端午節率人馬封鎖心導管室一事，之後承認當天有封鎖動作，但該心導管室隔天就恢復正常運作，並解釋是心導管室主任高憲立通知他電腦排程管控有問題，台大醫院資訊室的「小老虎代碼」被封鎖，他才在端午節放假期間趕到醫院緊急處理，因為擔心導管室內的電腦室出問題會透露病人醫療資料，曝露病人隱私，違反醫療規定，所以需要緊急封鎖心導管室。
但黃冠棠緊接著又對立委周倪安改口說，他突然想到，當天會封鎖心導管室，是因為該心導管室有一台電腦儀器未完成驗收程序，尚未經過倫理委員會同意，因該台電腦儀器中的連線資訊系統必須和院內系統同步，因此需經倫理委員會程序，因驗收程序未完成，所以需封鎖不能使用。
熟悉台大醫院運作人士直言，黃冠棠在立法院的說法並不可信，因該心導管室內儀器早於去年11月已完成驗收，且儀器部分只需依正常採購程序取得醫療許可和驗收，根本不需要經過倫理委員會審查程序；又台大醫院心導管室內所有醫療設備向來不是資訊室負責的範圍，手術無菌管制區的門禁由心血管中心管理，資訊室人員非經同意不得擅自進入，也不能持有門禁卡，因此端午節當天，院長黃冠棠偕同無權限管理該區域的資訊人員擅闖心導管室作法，極為可議。
至於黃冠棠宣稱是為了電腦排程管控出問題才到心導管室的說法，熟悉台大醫院運作人士更認為「匪夷所思」，該人士指出，「排程」是方便病房和心導管室協調的工具，心導管室根據排程通知病房送病導管室準備，上面排訂的時間表是護理師和技術員紀錄的工作績效，即小老虎資訊，管理排程的主機置設在台大醫院的2樓資訊室，黃冠棠若是要緊急處理排程問題，不去2樓資訊室，怎麼會跑到5樓心導管室，明顯地點不對，黃冠棠所說的事情內容更是疑點重重。
