防疫醫師在第一線衛教宣導，並參與、指揮系統性的疫調，確保從篩測、控制感染源、治療到長期監測疫情有序推進，還兼要研究分析，不僅控制疫情，也對傳染疾病在各階段的防控有更宏觀的視野，得以在更上游的階段改善公共衛生政策及流程。
武漢肺炎去年十二月底拉響警報以來，台灣防疫受世界矚目，而造就這個成績背後，衛福部疾管署防疫醫師是不可或缺的功臣。首批防疫醫師於二○○五年招聘
包括中國大陸武漢市於十二月底通報不明肺炎，有防疫醫師在第一時間就將消息轉知疾管署；並於今年一月初開始，前往海空邊境協助檢疫；一月十三日防疫醫師洪敏南赴武漢探查疫情，更帶回高度可能「人傳人」的寶貴資訊；二月上旬，防疫醫師黃婉婷負責在中央流行疫情指揮中心記者會上，向民眾說明疫情、剖析確診案例。
防疫醫師也在此次疫情拿出「疫情調查」（疫調）的看家本領，以盡速落實隔離、阻斷感染源擴散，並協助中央及地方超前部署的防疫決策。
近日磐石軍艦一次爆發二十四名確診，防疫醫師加倍忙碌，因必須在任何時間隨傳隨到，讓一些防疫醫師的家人十分不捨。
事實上，這群在第一線衝鋒的二十餘位防疫醫師，可說是「十五年磨一劍」。他們從何而來？又為何能在這次抗疫戰役中扛起關鍵角色？
推動台灣防疫醫師制度的前疾管局（現疾管署）局長蘇益仁告訴《新新聞》，防疫醫師源於美國疾病管制與預防中心（ＣＤＣ）。二○○三年ＳＡＲＳ過後，他有感疾管局的防疫決策過度仰賴外部專家，平時推動政策也因缺乏專業參與而受業界質疑，因此推動修法導入防疫醫師。
修法後疾管局編制三十位防疫醫師，一三年升格疾管署後再擴增五名。首批防疫醫師於○五年招聘，現階段有二十餘位防疫醫師，包括感染科、內科、病理科、兒科等不同專長的醫師。
這些醫師都必須接受疾管署進一步培訓，包括赴美、歐進修，訓練內容有流行病學、現場突發疫情的調查與防治、生物統計、疫情評估監測系統等。防疫醫師平時也要閱讀大量文獻，熟悉各類傳染疾病的症狀、傳染途徑、病程、診療方式及歷史紀錄等。
防疫醫師的職責相當多，其中疫調是重中之重。這次台灣的武漢肺炎確診病例中，為釐清「案十九」病故的白牌車司機可能感染源，防疫醫師抽絲剝繭，與個案親友訪談，再檢視個案手機發話紀錄，警方協助定位，才找到個案載過從浙江返台的台商，並在台商身上驗出抗體反應。
疫調是防疫醫師職責重中之重
酒店小姐確診的「案三七九」，也是靠著防疫醫師察覺個案自述為家庭主婦有異，並由桃園市衛生局官員勸之以情，才突破個案心防。
防疫醫師敏銳的觀察力及判斷力，來自平時大小疫調累積的功力。十餘年來，舉凡醫院、學校、村里發生肺結核、流感、麻疹，甚至不明原因的群聚感染，防疫醫師幾乎無役不與，直奔現場率領疾管署及地方衛生機關人員疫調，還要撰寫成報告，提供防控建議，避免再發生。
疫調鉅細靡遺，不放過任何蛛絲馬跡。以疾管署刊載〈二○一六年高雄某大專院校腹瀉群聚事件調查報告〉為例，防疫醫師王功錦、洪敏南等參與調查。 （相關報導： 新新聞》陳建仁密訪美，引入美軍第7軍種，建立疫情關鍵戰力 ｜ 更多文章 ）
調查包括設計問卷，了解感染班級師生的症狀、發病時間、食用菜餚、就醫及住院情形等，並配合實驗室採驗檢體，送疾管署檢驗。陸續排除霍亂、沙門氏菌、桿菌性痢疾等幾種病菌後，驗出諾羅病毒陽性，還得符合症狀，才能確診為主病因，並要追到底哪道菜出了問題。
