屏東小琉球近幾年成為觀光熱點，雖然當地經濟隨著人潮湧入而向上發展，但蜂擁而至的遊客也讓環境不堪負荷。據了解，遊客數從2010年不到20萬翻倍增長至2019年的40萬，經過數年超量遊客的踩踏，生態脆弱的2個著名潮間帶（杉福及漁埕尾）已經明顯受損，屏東縣政府如今只好制訂規範並強化管理體制。
為保育珍貴的潮間帶生態，同時發展當地的觀光，達到「生態、生計、生活」的「三生」永續，屏東縣府在海洋委員會的指導及支持下，於2019年開始進行環境衝擊的生態調查計畫，並委託國立中山大學團隊辦理，先針對杉福及漁埕尾兩處著名潮間帶進行調查，目前已有些初步重要的跡象值得參考。
數據顯示，被眾多遊客踩踏的導覽區內生物種類數目和個體數量，都比導覽區外少約30％；另外，兩個潮間帶的生物密度和5年前同期調查結果相比，數字上大約少了80％。上述2個跡象表明，人類踩踏對於環境的影響及過去5年的觀光人潮已造成生物數量明顯減少，就算考慮採樣變異及大環境氣候變遷的影響，推測至少也減少了50％以上。 （相關報導： 「台灣曾3度非常接近大流行！」台大公衛：若用佛系防疫，部分民眾恐去極樂世界 ｜ 更多文章 ）
中山大學研究團隊為解決生態問題提出多項管理建議，透過拜訪工作坊，以及與在地導覽員代表和相關政府官員溝通後，終於取得逐步推動、滾動調整的共識。屏東縣府將於今（2020）年開始試行部分管理建議，再依成效滾動調整，包括於2個潮間帶內設置保護區、導覽路徑、繁殖期禁止夜間導覽及夜間使用紅光燈等；管制站人事也改由縣府專任聘用，以穩定人事及強化職責；針對2019年具爭議性的肚仔坪潮間帶，也將進行潮間帶及附近珊瑚礁浮潛熱點的生態調查。
