林飛帆加入民進黨出任副秘書長，不只使得2020大選綠營的對內路線、對外競合產生變化，對過去被視為與林較接近的時代力量，更是嚴重衝擊。原本預期會在未來輔選、政黨競合上出現影響效應，卻沒料到提前引爆時力黨內洪慈庸、林昶佐等友綠派，與黃國昌及黨中央的矛盾情節檯面化。而近日黃國昌揭露國安局私菸案的方式，和高潞‧以用辦公室違反利益迴避等爭議事件，時力黨內的裂痕愈加難以撫平。
林飛帆結束英國學業返國後，7月16日加入民進黨接任副秘書長，出乎許多人意料之外。尤其是過去林飛帆從反媒體壟斷、太陽花學運到島國前進時期，都與黃國昌、陳為廷併肩作戰，黃、陳2人日後加入時代力量，林雖未入黨，也一直與時力保持友好合作關係，一直到今（2019）年初，都還曾為時力立委補選參選人站台。且加入民進黨的前2天，林飛帆仍出席高雄時力募款餐會，與黃國昌同桌。
對待林飛帆的態度 民進黨人士與黃國昌大不同？
一位民進黨人士直言，林飛帆不論是私人關係、價值觀，都和時代力量更加接近，但為何不加入時力卻是來到民進黨，關鍵在於黃國昌。
據了解，民進黨幾位要角跟林飛帆互動，都是平等地討論、對話，甚至會設身處地，站在他的立場去設想，和黃的態度完全不同。
一位時力內部人士也坦言，林飛帆從英國回來時，現任黨主席邱顯智曾找前任黨主席黃國昌一起找林深談，盼他能加入時力，甚至替時力批戰袍，參選立委。
惟據透露，黃國昌把林飛帆當「小弟」看待的態度，徹底激怒林，最後3人的會面，有些不歡而散，也導致林飛帆入黨一事破局，林選擇加入民進黨，對時力打擊非常大。
另一位時力人士透露，除了立委以外，時力黨內願給林飛帆的位置是黨秘書長，但去年1124國民黨大勝，以及綠營視為「親中」的韓國瑜、柯文哲堀起，種種「亡國感」讓林主張，時力必須表態支持唯一願意與中國抗衡的總統蔡英文，然而黃國昌另有想法反對表態，也成為林飛帆選擇不加入時力的最大推力。
事實上，去年為了時力台北議員候選人與柯文哲合作，以及林昶佐表示柯「兩岸一家親」言論不代表統派標籤的說法，林飛帆曾經投書國際政論刊物《外交家》點名批評，但無損林飛帆與林昶佐的交情，林昶佐甚至到今年都還曾當面徵詢過林飛帆選立委，也勸原本還有「博士夢」的林飛帆不要出國念書，要留在台灣為明年選舉打拚。
過去林飛帆曾有多次參政的機會，太陽花學運後，到2016年、2018年選舉，本土黨都曾有人邀他參選，但過去林總是婉拒，昔日戰友陳為廷、黃國昌紛紛投身選舉時，他甚至選擇去服役、出國念書，刻意遠離選戰。
林飛帆加入民進黨 時力友綠派與黃國昌裂痕檯面化
至於時力內部的友綠派，原先就存在與黃國昌之間的裂痕，因為林飛帆加入民進黨，彷彿炸開的壓力鍋，從洪慈庸向黃國昌的喊話開始，一一檯面化。林飛帆的人事案，只是一個引信，揭露出時力幾年來埋藏的矛盾炸藥，而隨著黃國昌爆料國安局私菸案的方式同樣引來黨內不同意見，可見林飛帆選擇民進黨、婉拒時力的後續效應，仍將繼續延燒。
而關於林飛帆婉拒時代力量因素與黃國昌有關，黃透過辦公室表示，「並非如此」。昌辦說明，林飛帆入黨工作之事，主要由邱顯智洽商，黃只曾參與鼓勵賛成，並不清楚最後商談與原因。 （相關報導： 「哇！這些人怎麼都跑到華航」 從私菸案發現華航高層綠油油，呂秀蓮嚇一跳 ｜ 更多文章 ）
至於林飛帆受訪時，還原自己與黃國昌討論過程，並沒有被誰激怒，也不是基於此原因加入民進黨；林飛帆強調，自己既然已經進入民進黨，就不會再回應任何與其他的工作邀約的事宜，並不符合職業倫理。
