對此故宮發布聲明表示，此為錯誤報導。南院圖書館整修重點在於將固定式書架改為電動式密集書櫃，增加更多的圖書典藏空間，並且在原有的閱讀座位區之外，新闢閱讀交流空間，設置更多閱讀座椅，絕無報導所說「撤除桌椅、館藏書籍與書架，增設懶人區（懶人骨頭椅）」之情形，整修後的閱讀空間更不可能成為報導所述的「菜市場、遊樂場」。（故宮官方聲明）
這兩則新聞令人不勝唏噓，究其實，故宮的反駁看來似乎也顯得多餘，因為早在國民黨立法委員柯志恩的質詢內容中，關於所謂的圖書館改建問題早已浮出檯面。簡言之，現階段的南院除了相當「熱衷」戶外的土木工程以外，也汲汲營營地準備「改造」博物館空間內的規劃，之後的結果就是鯛魚燒也能在南院內販賣，圖書館成為自修中心。南院的圖書館原本是一個指標 —— 它的空間設計具有國際級水準，且以亞洲藝術文化為主題的設定相當明確。根據了解，國立故宮博物院在北院的圖書館是以處級單位存在，南院的圖書館則被併入一個科（教育展資科） 之內，在人員編制上則更懸殊，北院有近二十位專員負責圖書館業務，南院則只有區區一位正職人員，最有趣的是南院的圖書館被戲稱為冷宮，通常犯錯的員工會被發配到那裡去，畢竟如果連某些官員都不專業，任何的行政措施當然都不專業。
現在的南院圖書館早已成為自修中心，院方不顧專業地開放供附近學生自修，溽暑往往一位難求，而且增加許多懶骨頭沙發及「文青」檯燈，更對外以「網紅打卡熱點」宣傳，菜市場與遊樂場之實早已成真，其實這一點也不怪，畢竟該南院前年 （110年） 一月曾與農糧署舉辦明火外燴「糧倉大戲」，假青銅器展覽為名卻一點也與青銅器無關，為了掩人耳目南院處當時還特意用帆布遮掩外燴器具，此舉當時遭到國民黨不分區立委溫玉霞的質詢「指活動在南院建築物附近放瓦斯桶，在館內辦桌，在院區辦流水席，無公共安全意識，院內走廊擺大桌，破紀錄，油煙損害文物，瓦斯桶爆炸誰負責。」，當時也遭到立法院院長蘇嘉全的裁示要求南院必須遵守故宮嚴格不得明火的規定，有趣的是經此一案之後，南院原本的規定卻被放寬了，至於本院依舊恪守不得使用明火的鐵律，原來一個小小顏色正確的長官就能讓百年故宮自我閹割。有關圖書館的後續荒謬情節依舊上演中，但反正南院日後定能撇得一乾二凈。
此外，圖書館的「修建」並未曾問過原建築師姚仁喜的專業意見，因為樓層的負載本來就有標準，增加了書櫃等等設施必然影響原來的力學基準。除了室內之外，南院也在室外大興土木，例如由北面停車場增建了一座「隧道」至南院本體建築，該隧道以鄒族為名卻又一點跟鄒族無關，據聞該工程也未曾有過環境影響評估報告，原建築師姚仁喜對於南院的空間美學理念已被破壞殆盡，不知道這是否就是所謂的瑜亮情節？據聞南院的管理階層中也有成大建築所畢業的高材生，理論上不至於不懂這個道理。
