3月8日陳儀報告蔣介石關於二二八處理委員會來見他的事情，他特別誇說：「處理委員會內部已起衝突，現正發生分化作用，一俟劉師長廿一師之一團開到台北，即擬著手清除奸匪叛徒，絕不容其遷延坐大 。」在軍統特務的運作下，果然分化了處理委員會。3月10日援軍已到達，陳儀就把他允許成立的處委會，誣陷為圖謀叛變，並報告：「二二八事件處理委員會圖謀叛變，今已令撤銷。」
國民黨製作名冊，美麗的福爾摩沙為此流血
依照國民黨的運作，重要決策會先由黨部和從政黨員開會做決定，要殺害台灣菁英的決定應會如此。上述中統局1947年3月11日的情報也說：「台省黨部調統室曾建議警備部，應乘時消滅歹徒，並將名冊送去。警備部10日晚起開始行動，肅清市內奸徒。」這個情報證明，從3月10日晚起，照省黨部的名冊逮捕及謀殺台灣菁英。「乘時消滅歹徒」證明台灣省黨部藉着二二八的動亂，乘機謀殺無辜的台灣菁英。一般來說，名單是單頁，名冊是很多頁訂成一本。外省官員剛來台灣，不瞭解台灣的內情，台灣省黨部內的半山們才知道誰是台灣的菁英。吳濁流在〈台灣連翹〉記載，1973年底曾出任國民黨省黨部指導員的彭德向他透露說：「（二二八）被捕的黑名單上台灣人二百多名，…是從重慶回來的半山幹的，他們是劉啓光、林頂立、游彌堅、連震東、黄朝琴等人。」吳濁流也感慨地說：「只因這份黑名單，悲劇的歷史上演了，美麗的福爾摩沙為此流血。」
那時屬於訓政時期，以黨領政及以黨領軍。省黨部主委李翼中本來計劃在3月6日飛去南京，要攜帶陳儀的信，向蔣介石當面報告二二八的情形及請求派兵來台灣。既然是這種企圖殺害二百多位台灣菁英的重大事情，李翼中應該會在3月6日或之前，親自把台灣省黨部所製作的這本台灣菁英的名冊轉交陳儀，要求他執行逮捕，但因6日沒有飛機班次，才改在7日成行。這就解釋為什麼陳儀會在3月6日成立別働隊，預備來執行逮捕及殺害的工作。
警備總部參謀長柯遠芬在他的口述紀錄說：「3月9日陳長官宣布全省戒嚴後，陳儀就下令由憲兵張慕陶團長主其事，警總調查室、軍統局台北站協助之，緝捕為首陰謀份子。」、「逮捕人犯係由軍統局林頂立成立特別行動隊及張慕陶憲兵團成立特高組，會商後立即進行迅雷不及掩耳的行動。」和「不過，陳長官將逮捕名單交與張慕陶，囑其不可告知上述單位以外人員，而由陳長官直接向蔣主席負責。」〔58〕這些報告證明陳儀主導逮捕及殺害台灣菁英的暴行。
當時擔任警備總部副參謀長的范誦堯更特別指出：「林頂立成立特別行動隊與憲兵成立特高組，全面逮捕人犯。至於槍斃人犯，多由軍統局林頂立負責。」〔59〕憲兵來自中國，不懂台語，也不熟悉台灣的地址，但其特高組可以提供武力和人員；別働隊內的台灣人特務則負責帶路和辨認被逮者的身分。別働隊參與非法逮捕、拷問、槍斃及滅屍。林頂立身為別働隊司令負責對外聯繫及整個別働隊的策劃，實際工作應由副司令、參謀長等來執行，因此陳達元特別褒獎副司令劉明和陳逸松：「協助弟緝捕奸逆，表現至佳」。
