台灣與澳洲2017年9月簽署備忘錄，提供諾魯拘留營的難民醫療服務，但澳洲媒體指出，澳洲政府為了避免難民踏上澳洲本土，而台灣因無難民相關法規，就醫難民無法申請庇護，只能被迫返回拘留營，因此選擇與台灣合作，此事引發極大爭議，對此澳洲駐台辦事處今（25）日發布聲明，強調所有就醫難民都是自願到台灣接受醫療診治，也同意療程結束後，回到諾魯拘留營。
澳洲駐台辦事處（Australian Office in Taipei）在臉書貼文稱：「感謝台灣為諾魯的醫療轉診者所提供的優質醫療服務。在醫療轉診的安排下，在諾魯進行『區域處理』的病患可獲得諾魯當地無法提供的專科醫療服務。在轉診到台灣之前，所有病患都自願同意在台灣接受醫療服務，也同意在出院後回去諾魯。台灣優質的醫療服務與對國際醫衛的貢獻都是獲得全球好評的。台灣與諾魯醫療合作計畫也行之有年。」
台灣外交部發言人李憲章24日表示，澳洲政府考量台灣醫衛與照護水準，及台諾多年醫療合作經驗，於2017年9月間與台灣簽定合作備忘錄，由臺安醫院自今年1月起，協助現居諾魯的難民及尋求庇護者，在緊急且於諾魯無法獲得及時醫療診治的情形下，轉送來台接受醫療照護。他強調，備忘錄中明訂締約雙方應遵守國際人權標準，確保相關當事人受到有尊嚴的對待及妥適的診治照護。
李憲章還說，作為國際社會積極及具建設性的成員，台灣樂願與國際社會共同關心及致力提升全體人類的健康。台灣將持續秉持普世人權與健康價值的原則，協助友邦提升醫療水準，並與理念相近國家，繼續深化在醫療援助、人道救援、跨國防疫等全球性議題上的合作，以實現「健康無國界」的目標。
澳洲《雪梨晨鋒報》日前報導指出，「台澳備忘錄」引起澳洲律師關切，因為醫療權利變成政治命令，此舉是為了避免諾魯拘留營（Nauru Detention Center）的難民到澳洲本土就醫後，向澳洲法院申請留在境內定居。而台灣不是1951年《難民公約》（Refugee Convention）締約國，本身國內也沒有相關難民法規，因此來台就醫的難民，沒有法律依據可以申請庇護，只能返回拘留營。
Extremity of Aust responsibility shirking: hiring States for human warehousing - then hospitalisation of the harmed https://t.co/StGFWe5h9R
— David Manne (@david_manne) 2018年6月24日
澳洲內政部發言人22日證實「台澳備忘錄」的存在，但不公開備忘錄內容，強調台灣「醫院設施和醫療技術在全球一直有很好的評價」，並告訴《雪梨晨鋒報》「部分個案到過台灣接受治療，也已返回諾魯拘留營......政府已明確表示，接受區域處理安排（regional processing arrangement）的人不能安置在澳洲境內，醫療轉移不是轉至澳洲居留的捷徑。」 （相關報導： 台灣與澳洲的「難民外交」》展現人道精神？淪為大國幫兇？澳洲媒體：就是不想讓難民入境，才會送來台灣 ｜ 更多文章 ）
The Guardian view on the Nauru files: Australia’s offshore detention centres breed misery | Letters https://t.co/KfwiUjPBGX
— The Guardian (@guardian) 2016年8月11日
2016年8月，英國《衛報》公布「諾魯檔案」（Nauru files），獨家披露位於諾魯和巴布亞紐幾內亞（PNG）馬努斯島（Manus）上拘留營內，難民遭受慘無人道的待遇。2001年，澳洲時任總理陸克文（Kevin Rudd）與巴紐和諾魯達成協議，由澳洲出錢，巴紐和諾魯則出土地，在這2國領土上成立拘留營，安置向澳洲尋求庇護的難民，而澳洲政府的目的就是不讓難民踏上澳洲本土。
