立法院長王金平與國民黨之間的黨籍訴訟案，新任黨主席朱立倫傾向以不承接作法，讓此案自動撤銷。當初發動撤銷王金平黨籍的前主席馬英九，13 日在電視專訪中向朱立倫喊話，指此案一旦撤銷，等於認同高等法院認定考紀會無權做類似處分的見解，「以後黨紀處分怎麼辦？」呼籲國民黨應從黨的長遠運作考量，利用第三審機會釐清法律問題。
馬英九13日接受UDN TV專訪，被問到前檢察總長黃世銘因王金平案被判洩密有罪定讞時，坦承自己身為總統，雖對任何司法判決都尊重，「但對此案判決結果感到遺憾」。
對於朱立倫掌任黨魁後，傾向對王金平黨籍案採取不承接的作法，讓此案「消失」，馬英九首先強調，此案並非他個人涉案，而國民黨也是被告，「是被動的」。
馬英九同時表示，此案也不涉及馬王鬥爭或不和。他更以三年前國民黨在不分區立委提名時，特別為王金平修改條文，讓他得以連任不分區為例強調，自己完全沒有打擊王金平的誘因或動機。
馬英九說，王金平案涉及的是，面對司法關說的大是大非，國民黨的態度是什麼？他一向認為國民黨是清廉、勤政、愛民，但在黨籍案訴訟中，法院竟對事實部分完全沒有著墨，反而著眼於考紀會組成有問題，因為成員不是民選，所以認定考紀會做出的決定是違法的。
馬英九說，當時他就覺得非常錯愕：「法官也不是民選，怎麼能判人生死？」他強調，考紀會是根據全國代表大會通過的黨章所設立，脈絡很清楚；更重要的是，法官認為考紀會通過的考紀處分若是撤銷黨籍或開除，必須經過全代會1/2代表出席、2/3通過才能有效，「這根本做不到」，這是法官不了解政黨政治的實務，怎麼可能要求一年才開一次的黨代表大會來做這種決議？
馬英九說，法院判決不僅過深介入政黨內部事務，又脫離現實，若不去爭論這一點，等到此案一旦撤銷，等於接受高等法院的見解，以後不管考紀會怎麼改組，決議若沒有經過黨代表大會通過都無效，那將來立委馬上就要選舉，最近還有個新的案子也來了，「黨紀處分怎麼辦呢？」
雖未明指，但馬英九向朱立倫喊話，必須要為黨的長遠運作考量，這不是他個人的問題，而是黨要不要黨紀、怎麼維護黨紀的問題。他建議，應思考是否利用第三審即法律審的機會，把法律講清楚。
馬英九說，在一審二審沒有著墨事實部分，只談考紀會有沒有權力，「這是蠻奇怪的」，今天走到這一步，這個法律問題必須加以釐清，而這個案子本身涉及大是大非，也必須釐清。
至於國民黨是否再修改立委連任條款，讓王金平繼續出任不分區立委，馬英九則簡單回應，必須從制度面考量。
