李明哲案對台灣產生寒蟬效應，而中國涉台事務高層則認為台灣民眾對此案毋需過度聯想。至於可預見的未來兩岸關係發展，北京方面並不表樂觀。
李明哲案三個焦點引發關注
李明哲因涉「顛覆國家政權罪」被中國湖南省岳陽市中級人民法院判刑五年，他本人放棄上訴。這個判決最引發台灣關切之處主要有三點：首先，這是第一個台灣人以這個罪名被起訴並判刑，甚至港澳人士也未曾因此法條入罪。其次，李明哲刑罰中還包括剝奪政治權利二年這個附加刑。這看起來像在宣告台灣民眾也是中華人民共和國公民，所以中華人民共和國的法院可以剝奪他的政治權利。換句話說，中華人民共和國主權及於台灣。第三，李明哲在中華人民共和國境外、於社群媒體上發表評論批評中國時政，這是否代表著，以後在台灣或其他中國境外發表類似言論，都有可能成為中國當局起訴的罪證？首先，刑法是屬地主義，也就是在某個主權領域內犯罪，不論任何國籍都適用。「顛覆國家政權罪」屬於中國《刑法》第二編第一章「危害國家安全罪」部分，不論外國人或本國人都可能是犯罪主體。
對岸刑法可剝奪外人政治權利
依中華人民共和國《刑法》一○五條規定，「顛覆國家政權」罪名是指「組織、策畫、實施顛覆國家政權、推翻社會主義制度的行為」。這些行為不限於暴力，此法條第二項規定「以造謠、誹謗或者其他方式煽動顛覆國家政權、推翻社會主義制度的，處五年以下有期徒刑」，李明哲的判決書並未公布，但很可能就是被依這項條文判刑。
此外，上述《刑法》一○七條規定，境內外機構、組織或者個人資助實施一○五條規定之罪，「對直接責任人員，處五年以下有期徒刑、拘役、管制或者剝奪政治權利」。其中的確包括了「剝奪政治權利」一項。當然，中國當局選擇在何時、用哪條法律判刑必有政治考量，而判刑結果也有其政治效應，這也是台灣各界所擔憂的。對此，北京一位涉台事務高層私下指出，台灣這些憂慮是「想太多了」。這位高層表示，李明哲剛好遇到《境外非政府組織境內活動管理法》（簡稱《境外ＮＧＯ管理法》）實施，所以依這個法被起訴、判刑。 （相關報導： 「李明哲是無罪的」 陸委會五點聲明：滾動修正兩岸政策 ｜ 更多文章 ）
涉台高層：與內地串聯才被判刑
依《境外ＮＧＯ管理法》四十七條規定：「境外非政府組織、境外非政府組織代表機構有分裂國家、破壞國家統一、顛覆國家政權等犯罪行為的，由登記管理機關依照前款規定處罰，對直接責任人員依法追究刑事責任。」相關法條並未訂明刑責，所以回歸到《刑法》「危害國家安全罪」部分，依相關條文處理。至於剝奪李明哲政治權利是否涉及對台灣的主權宣示？這位涉台事務高層認為這是過度推測。他除了強調，剝奪政治權利不只是對本國公民，對境外人士也適用，並指出，政治權利不只是選舉與被選舉這些權利，還包括出版言論等權利。此外，一般民眾最關心的是：在海外批評中共政權，是否也可能因此在入境中國後被抓捕？這位人士則稱，李明哲之所以被起訴，是因為他與境內團體串聯，並非是因為在海外發表批抨中國政府的言論。他舉香港為例，說當年主權回歸時，中央政府也明確表示，香港可以批評內地問題。至於李明哲案是否為針對中國學生周泓旭共諜案的反制？這位人士並未正面回覆，只說很多人也批評周泓旭案有很多不合理之處。
