對於不服從的僧侶，中共除了將他們逐出寺院、開除僧籍、逮捕入獄，甚至徹底關閉寺院，還會對他們直接開槍。2015年7月一個著名的案件中，西藏宗教領袖丹增德勒仁波切在中共監獄中突然身亡，當局禁止家屬帶走遺體，引起了當地民眾的抗議，當地也聚集1000名悼念他的群眾，中國安全部隊對著手無寸鐵的民眾開槍驅離，至少15人因槍傷送醫。
「蘿蔔加大棒」鼓勵藏人出賣同胞
中國當局還分別採取各種不同的「胡蘿蔔加大棒」的政策，來促使藏人順從政府各項指令和舉報他們的同胞。政府提供最高20萬人民幣（約新台幣100萬元）的現金，獎勵舉報自焚事件和抗議行為。
政府也會支持忠誠的寺廟，威脅不服從的村民和家庭，甚至禁止他們採集冬蟲夏草，斷絕他們重要的收入來源。
藏人甘冒死亡風險 積極反對政府打壓
儘管政府以監禁、酷刑甚至值機開槍鎮壓的方式打壓藏人的宗教自由，每年依然有許多藏人僧侶和民眾以積極和政治性的抗議方式，反對政府對宗教的打壓政策，但大部份抗議都是非暴力的形式。而近來在藏區發生最為激烈、極端的形式則是自焚，自2011年以來，該地區發生超過140起自焚抗議事件。
最初自焚的主要還是僧尼，但是有越來越多的信眾也跟著自焚，到2016年中期，自焚者中的信眾人數已經超過了僧侶。而約95%有記錄的自焚事件都發生在西藏自治區以外，其中以四川省發生數量最多。報告認為，這種差異或許反映了西藏自治區對抗議運動和資訊更加嚴格的管控，以及在2010年之前相對自由的地區，對打壓政策更加強烈的反應。
有些藏人則會選擇逃亡境外，報告指出，在2008年以前，每年有數千藏人逃亡，但隨著西藏高原各地越來越多的警方檢查站和尼泊爾邊界的軍力增強，逃亡這個選項基本上已經被堵死。留在當地的藏人有些會選擇與中國政府洽商，最突出的案例是現年26歲由政府認定的班禪喇嘛確吉傑布。這些宗教領袖則試圖與地方官員建立起一種合作性的關係，以此來緩解衝突和抵禦迫害。
很多僧侶和一般信眾則秘密保有達賴喇嘛的畫像，將畫像藏在盒子裡、在照片框背後、存在電子設備裡，或是在毯子下面。有些地方官員或是同情藏人、或是「睜一隻眼閉一隻眼」，在這些地區僅僅禁止公開張貼畫像。很多藏人還是會在家中私下教育他們的孩子有關達賴喇嘛的事，或是其他他們或許無法透過一般管道接觸的藏傳佛教的教義原則。
