自從巴黎政府承諾要在塞納河中舉辦奧運賽事以來，全世界的焦點都在「大腸桿菌」的數量上，而非運動員和賽事本身。南非鐵人三項運動員斯科曼（Henri Schoeman）在賽後向「法國24台」表示，整個比賽都在討論水質，相當可惜。對於鐵人三項的運動員來說，相比大腸桿菌，湍急的水流、不充分的練習機會，和「對鯊魚的恐懼」才是更大的挑戰。
儘管耗資15億美元（約合台幣499億）整治，塞納河仍因連日降雨導致大腸桿菌數量超標，因此不僅鐵人三項的練習賽遭取消，男子賽事也被推遲一天舉行。在31日凌晨獲得水質達標的檢驗報告後，女子和男子的鐵人三項賽事分別在當地時間早上8點和10點45分舉行。
不少運動員在賽後接受外媒訪問時表示，大家對於大腸桿菌的擔憂有點過頭了。排名第9的加拿大選手米斯洛楚克（Tyler Mislawchuck）向《時代》雜誌表示，身為在世界各地不同水域比賽的鐵人三項運動員，不可能會在每場比賽中都對水質斤斤計較。不少運動員也對大腸桿菌的問題感到厭倦。想像你剛實現了奧運夢想、並完成挑戰人體極限的運動——完成1500公尺的游泳、40公里的自行車和10公里的長跑——結果大家只在乎「大便」問題。
有選手選擇以幽默的態度回應塞納河的水質問題。美國鐵人三項選手萊德（Seth Rider）曾在賽前開玩笑地表示，為了增強對大腸桿菌的免疫力，他刻意將自己曝露在細菌中：「這是有科學支持的。例如在上完廁所後不洗手。」即使萊德在賽後澄清這只是個玩笑話，並幽默地表示希望自己真的能對大腸桿菌免疫，因為他在比賽中吞下太多河水，但沒想到許多網友還是把萊德的笑話當真，並紛紛在他社群平台的貼文下留言「去洗手」。一名網友嘲諷地回應：「為了這一天，這個傢伙付出一生的努力，但大家只在乎他有沒有洗手，酷喔。」
當記者詢問美國選手尼布（Taylor Knibb）水的味道如何時，尼布打趣的回道：「我喝了很多瓶裝水，味道很好。」記者隨即澄清他指的是賽納河的河水，尼布則表示：「我在比賽中並沒有想到這個問題，但如果你真的想知道的話，我可以去裝一杯給你喝。」
奪下女子鐵人三項金牌的法國地主選手伯格朗（Cassandre Beaugrand）對《時代》雜誌說：「我並不擔心塞納河（的水質），因為我們在去年的測試賽就游過了，也沒有任何人因此生病。我有絕對的信心在塞納河裡游泳，而且不這麼做的話就太可惜了。」
比起大腸桿菌，選手們更擔心的是塞納河湍急的水流，伯格朗向「法國24台」表示：「我數次對水流感到擔憂，因為它不斷阻止我前進。」獲得男子金牌的英國選手余力生（Alex Yee）也提到他在比賽中有好幾次都被水流沖走。排名第25名的南非選手里德爾（Jamie Riddle）向《時代》雜誌表示，即使有衝浪背景，塞納河的水流仍舊讓他震驚：「我一直處於激流中，這比我經驗過的任何海浪都還難以招架。」 （相關報導： 巴黎奧運》大腸桿菌檢測過關！塞納河水質終於達標，鐵人三項不會少一項 ｜ 更多文章 ）
選手們也對比賽有些埋怨，但都與水質無關。沒有參加到去年測試賽的阿根廷選手比亞喬利（Romina Biagioli）認為，主辦方並沒有提供公平的練習機會：「我認為這是運動員的權利。」並表示應該提供選手更多暖身練習。德國選手魯爾斯（Lasse Luhrs）也向《時代》雜誌抱怨，男子賽事從原訂早上8點舉行，改成更潮濕悶熱的10點45分開始：「我認為主辦在比賽前一天改時間並不是很公平。有些人可以在炎熱的環境下更好地完成比賽，有些人則不習慣。」魯爾斯認為如果他提早得知比賽會在接近中午的時候進行，他會改變賽前的常規訓練以適應溫度。
