李範奭因為過去在青山里戰役的戰功，被金九延攬到韓國光復軍擔任參謀長，總算是有了一展長才的機會。沒想到國民政府軍事委員會堅持朝鮮義勇隊應併入韓國光復軍，同時還要求對韓國光復軍有絕對指揮權，不允許大韓民國臨時政府插手。所以李範奭與國民政府之間的衝突，其實打從韓國光復軍一成立就爆發了。
韓國光復軍與盟軍的合作
光復軍被納入軍事委員會的指揮體系後，國民政府派遣武昌起義元老尹呈輔中將擔任光復軍參謀長，李範奭被降了一級成為副參謀長。為此他對國民政府抱怨連連，晚年曾回憶道：「中國當局甚至干預了極小的人事安排問題。他們指名道姓，讓中國人來出任什麽參謀長、處長等等，提出根本不是協定的協定，以高高在上的姿態施加壓力……因此，困難的事情經常發生。」
顯見李範奭雖然屬於大韓民國廣義上的「中華民國派」，但是他與國民政府的合作並不愉快，有的只有寄人籬下之感。甚至當年蔣中正如何看待史迪（Joseph W. Stilwell）將軍對國民政府的「指指點點」，李範奭就如何看待蔣中正對韓國臨時政府的「指指點點」。國民政府對韓國獨立運動的支持，並沒有我們後人想像的那麼浪漫。
朝鮮義勇隊被併入韓國光復軍後，改編為韓國光復軍第1支隊，不過因為該支隊成員多數左傾，且許多人逃亡延安加入中共扶持的朝鮮義勇軍，因此第1支隊毫無戰力。原本的光復軍則改編為第2支隊，就由李範奭將軍擔任支隊長。第2支隊在胡宗南將軍管轄的西安活動，那裡天高皇帝遠，總算是讓李範奭有了更多的行動自由。
他與美國戰略情報局的薩金特（Clyde B. Sargent）上尉搭上了線，開始以西安為基地派遣韓籍特工潛入華北、滿洲國以及朝鮮半島從事情報活動，總算是做了些真正像樣的抗日行動。胡宗南將軍對戰略情報局與韓國光復軍的合作採取全面支持的態度，譜出了戰爭末期一段難得的美中韓三國情報合作史，為此薩金特、李範奭與胡宗南都功不可沒。
不過等到日本投降後，美國與大韓民國臨時政府的矛盾立即浮上檯面。雖然李範奭在魏德邁（Albert C. Wedemeyer）將軍和薩金特支持下，於日本投降後第二天就率領22名美軍與光復軍官兵組成的小組飛往朝鮮與日軍談判，期待爭取日軍將武器交給光復軍。然而日軍朝鮮軍司令官上月良夫中將卻有不同的看法。
成為韓國右派領袖
原來日本在朝鮮的末代總督阿部信行為了維持日本在朝鮮的利益，暗中支持前左翼獨立運動家，太平洋戰爭爆發後轉而支持「大東亞共榮圈」的呂運亨出山，成立朝鮮人民共和國。呂運亨以國家副主席自居，並邀請人還在美國的李承晚擔任國家主席。負責佔領南韓的美軍第24集團軍當然無法容忍這樣的左翼國家存在，抵達漢城後就將朝鮮人民共和國解散。
