陪前總統李登輝到臨終的前李登輝辦公室主任王燕軍，將擔任台北市長柯文哲的市政顧問。據指出，在柯文哲親自邀請下，王將於下週上任。原傳出王燕軍要接下柯文哲辦公室主任一職，柯的辦公室主任過去也一向由市政顧問兼任，不過，據了解，柯目前與王只談到市政顧問職務，並未觸及辦公室主任，但僅市政顧問一職，過去也一向是柯文哲擺放重要參贊機要的位置，民眾黨立委蔡壁如、前柯文哲人馬洪智坤與張益贍都待過此位。
環南市場事件聲望受衝擊 柯文哲找上王燕軍
據指出，今年1月，柯文哲因為關心李登輝紀念圖書館的設立，與王燕軍有所接觸，當時柯就希望王到市府協助他，但後來未有進展，直到最近在環南市場防疫等事件爆發，柯文哲聲望再度受到衝擊後，柯再度找上王燕軍。
據了解，柯對於市府組織動能為何在此次發揮不出來挫折感很深，因此希望王能到市府協助他。據指出，王燕軍要求不要開會，柯也承諾其職務不用簽到，王對於有給職、無給職等、都未與柯文哲確認，柯文哲要他下週就上班。
守護李登輝到最後一刻 王燕軍是其最代表性的部屬
柯文哲2014年競選台北市長時，曾透過醫界聯盟人脈爭取李登輝支持，當時李方的對口就是王燕軍。李登輝在世期間雖培養不少人馬，但留在身邊照顧他到臨終的，除了家人以外，王燕軍為最具代表性的部屬。
李登輝於2020年7月30日晚間過世，大體在當天深夜10點從病房移靈到榮總懷遠堂冰存，一路護送李棺木到懷遠堂的，就是王燕軍。據了解，李生前也曾親自囑咐王燕軍，過世後要替他照顧孫女巧巧（李坤儀）和太太曾文惠。除了李的親自託付，據指出，總統蔡英文於李過世時，也責令王燕軍，在李身邊料理好後事，守護李登輝到最後一刻。 （相關報導： 林昶佐環南嗆市長反被洗臉 劉寶傑諷：他壞了中央要丟鍋柯文哲的好事 ｜ 更多文章 ）
王燕軍的李登輝色彩極重，柯文哲在施政危機與綠營極討厭他的時候，把李登輝人馬拉到身邊，會引發綠營與目前較支持柯的偏藍色支持者如何的反應，引發關注。
