國民黨主席吳敦義上任後，立馬推動地方黨部主委直選，不過，多處地方因派系擺不平，而以「2018年勝選考量」為由暫緩直選，但事實上，目前確定要推動主委直選的10個縣市，派系衝突的問題也不小，在2018年地方選舉前的這場地方黨部主委直選，宛如埋在各縣市的「不定時炸彈」，隨時可能引爆。
目前黨中央確定推動黨部主委直選的10個縣市，包含台北、新北、桃園、台南等4都，以及新竹、花蓮、台東、屏東、金門、連江等6縣。
先從推動主委直選的縣市來看，大概可區分成兩種類型。第一種是「宿敵對決」，花蓮縣就是一個典型案例；第二種是「裁判兼教練、教練兼球員」，以新竹縣等代表。
花蓮縣黨部主委直選，傅崑萁與宿敵對決
花蓮縣長傅崑萁任期已滿，有意交棒給妻子、立委徐榛蔚，在花蓮市長補選一役，以傅崑萁為首的傅派，全力輔選花蓮市長魏嘉賢有功，反觀以議長賴進坤為首的反傅派，則因賴進坤站了對手的台而被考紀處分，遭開除黨籍，所幸因打官司而保住黨籍。
地方人士指出，賴進坤有意挑戰縣長寶座，是徐榛蔚的一大競爭對手，傅崑萁運作縣黨部開除賴進坤，目的當然是為了替妻子搬開石頭，同時輔選魏嘉賢成功，替妻子守住花蓮市的灘頭堡。
不過，賴進坤保住黨籍之後，加上黨主席易主，情勢也悄悄逆轉。被歸類為「友傅」的前主委張逸華去年底「閃退」，派任的新主委水雲翔與傅崑萁淵源不深，給了「反傅派」機會，要水雲翔「嚴守中立」。
議長賴進坤與前黨部主委蔡啟塔結盟，反傅派大運揮軍縣黨部
為了挑戰縣長大位，賴進坤有意參選縣黨部主委，因涉貪遭停權的前主委蔡啟塔可能推妻子黃素員出馬角逐，蔡啟塔目前任職於縣議會秘書，蔡、賴結盟態勢明朗，另前行政院東部聯合服務中心副執行長林有志也有意角逐，反傅派大軍揮軍縣黨部。
反觀傅派，僅有醫界出身的前花蓮市黨部主委鄒永宏出馬，另魏嘉賢胞弟、花蓮市民代表魏嘉彥打著為花蓮注入年輕世代的口號參選。魏嘉彥是吳敦義的新願景論壇協會舉辦的「青年活水營」第二期成員，據指出，魏嘉彥已當面向吳敦義表明參選理念，讓已經混亂的戰局再起一波漣漪。
新竹縣「裁判兼教練、教練兼球員」
新竹縣的部分，更是讓外界摸不著頭緒。副議長陳見賢在黨主席期間力挺吳敦義，選後被派任接下縣黨部主委一職，但陳見賢意在爭奪縣長邱鏡淳屆滿後的縣長寶座，並規劃「先搶主委、再攻縣長」。
因此，先撇開陳見賢的選務中立問題不談，地方上有意角逐縣長寶座者，都被逼的要提前上陣，先搶黨部主委一職，讓主委直選反而成為縣長初選的前哨戰。
目前國民黨內欲爭取新竹縣長提名者，包括林為洲、陳見賢、副縣長楊文科及湖口鄉長林志華等，形成多強爭霸的混戰局面，其中，陳見賢、楊文科均先將著眼於搶下縣黨部主委一職，黨內競爭態勢漸趨白熱化。
新任主委若有意參選主委，必定要先請假迴避選務中立問題，因此9月初上任的主委，在9月中選舉公告時要請假，以避免「裁判兼球員」，接著若選上主委，要辦理縣長初選時，若又有意參選縣長，黨部主委又得再度請假，避免「裁判兼教練、教練又兼球員」。 （相關報導： 國民黨全代會》地方黨部主委直選通過 預計11月交接 ｜ 更多文章 ）
林為洲說，如果新任主委與縣長候選人為同一人，那當然自己為自己籌經費輔選是天經地義，但如果請假的新任主委參加縣長初選失利，根據黨部主委直選辦法，主委有2年的任期，回任主委後是否會願意為競爭對手募款輔選，還是可能會扯後腿，加上鄉鎮市長的佈局考量，是否能達到團結一致，這是黨中央必須思考的問題。
