台北市議會5日開始進行總質詢，市長柯文哲備詢時被新系綠營議員問及萊豬進口議題，稱柯文哲本身不懂美豬爭議。柯文哲5日晚間在臉書發文，表示北市府已正式回函給政院對萊豬進口表達意見。柯文哲指出「我們很樂意溝通，重點是要通」。
台北市議會4日三讀通過《食安自治條例》，未來北市販售豬肉及製品不得含有瘦肉精，否則最高開罰10萬，還可按次處罰，但必須送行政院核定後才能公告執行。
柯文哲近期也都在臉書發文，要求做好源頭管理、明白標示，但民進黨新系議員5日質詢時稱柯文哲不懂，因為農委會相關標示已經很清楚，且應等中央管理辦法出來，而非跟藍營起舞，副市長黃珊珊在備詢時表示，北市會回函給政院。
柯文哲在臉書發文指出，北市衛生局及相關局處過去幾個月一再表達地方政府碰到的困難，希望中央能做好源頭管理、明白標示，讓地方政府好做事，真正保障民眾權益，只是一直沒有得到答案，5日北市府已正式回函給行政院，針對萊豬進口表達3意見。
柯文哲指出，第1是源頭管理，要清楚告知進口管理流程圖；第2是萊劑殘量容許值，應與國際標準一致訂為10ppb，而非目前的0.01ppm，故意放水；第3則是增加萊豬貨號，方便後續的追蹤管理與市場標示。
