除了懷疑大國強權，也有專家認為飛行員才是真正的兇手，新西蘭飛行專家、Kiwi航空公司創始人伊萬．威爾遜（Ewan Wilson）認為，MH370的機長患有精神失常，他駕駛飛機自殺，而乘客與機組人員成了他的陪葬品。伊萬認為，航空行業對駕駛員的精神健康狀況並不重視，但是他的調查發現，過去三十年中，發生了五起駕駛員自殺、或謀殺乘客的飛行事件，這些事件已經奪走了四百二十二條生命。伊萬在自己的新書中推測，飛機機長將自己鎖在駕駛艙內，然後刻意降低客艙氣壓，使得乘客與機組人員因窒息而死，最後駕駛著飛機完整墜落印度洋。伊萬的理論解釋了為何機上乘客無人求救，以及為何飛機殘骸至今未發現。
這些陰謀理論如同懸疑大片，陰謀論大行其道的根本原因，是缺乏可信的官方消息。雖然馬來西亞政府一直宣稱沒有隱瞞任何事情，但是當局多次搜索未果，到如今突然地宣布MH370失事，讓外界質疑仍然在隱瞞真相。
英國記者和作家David Aaronovitch則認為，本質上說，陰謀論的存在，是因為這些人不能面對混亂的思維。他們不能面對生活中意外和偶然的作用，總是把事情歸咎到某些機構。
雖然陰謀論層出不窮，衆多航空、軍事專家各執一詞，但是他們能肯定的是，這是一場計劃周密、執行嚴謹的高難度行動，飛機駕駛者在切斷飛機通訊、躲避雷達監控上技巧高超。
在MH370失蹤一週年之際，前台灣華航機師閻駿表示，飛行員群體對馬航失聯的分析，已經沒有太大分歧，他的理論是，飛機上的乘客已經被駕駛者殺害，因此失聯飛機上沒有乘客發出求救信號，飛機可能由駕駛員操控，也可能遭到乘客劫持，最後飛機在人為操作下迫降南印度洋海面。
閻駿認為，駕駛者讓乘客失去意識的手段是駕駛飛機迅速爬升，降低艙內氣壓，使乘客窒息而死，而據觀測數據，MH370在失聯後，曾經突然爬升到四萬五千英尺的飛行高度。閻介紹，客機引擎有兩個功能，一個是為飛機提供動力，另一個則是為機艙增加氣壓，而這段爬升耗能巨大，引擎不一定能保證同時為機艙增壓。但是駕駛室和機艙隔離，且機長的氧氣瓶容量更大，這保證駕駛人在乘客死亡之後，仍能安然駕駛飛機，巧妙的躲避雷達飛行，最後飛入南印度洋。
閻駿認為駕駛員的嫌疑較大，但是不排除乘客劫機的可能，他說，駕駛艙內並沒有衛生間，機長如果出來方便，劫機者便可趁此時衝進駕駛室，關掉通訊設施，奪得飛機控制，因此，座位接近駕駛室的頭等艙旅客更有嫌疑。
閻推測，在殺害了機內乘客和機組成員之後，駕駛者完全有能力在水面迫降，飛機在水面迫降之後不會立刻下沉，這也為前來接應的船隻甚至潛艇提供了時間。印度洋南部十分適合隱秘迫降，閻駿分析，印度洋南部海域距離其他大陸的距離很遠，不易被地面雷達監控到，而且這片水域水面平穩，十分適合迫降。
