（漢娜與海因里希不論在婚姻和學術生活上，都非常合拍。）
一九四三年，漢娜和海因里希聽到奧許維茲種族屠殺的事情。一開始，他們拒絕相信：因為這在軍事角度來說完全沒有道理。〔美國聯邦大法官費立克斯．法蘭克福特（Felix Frankfurter）得知奧許維茲的報導細節時也不肯採信，他的理由也是如此。］六個月後，新的鐵證陸續浮出檯面，「這彷彿是地獄敞開大門，」漢娜回憶。對猶太人施行種族滅絕，以及為了加速毀滅猶太人而成立的機構，都意味著肇下無可赦免的罪行，無法為它尋找合理藉口，也沒有任何刑罰可以補贖。漢娜對此深感震驚，促使她開始寫作《集權主義的起源》（The Origins of Totalitarianism），這本書於一九四五年完稿，一九五一年出版。在書中，她指控「種族思想」和集權主義以及帝國主義相互連繫。
一九四六年，漢娜在一篇刊載於《黨派評論》（Partisan Review）的文章，點名批評海德格，說他不但加入納粹黨，還禁止他的恩師兼摯友胡賽爾在大學任教。（實際上，胡賽爾被禁止在大學任教，早於海德格擔任校長之前就已發生。）一九四九年，漢娜回德國拜訪卡爾與吉兒楚．雅斯培夫婦，他們在海德堡熬過納粹統治，存活下來。漢娜與雅斯培最重要的共同處，就是他們各自對海德格都有強烈的觀感與情緒：雅斯培是海德格哲學領域的同行好友，而漢娜則是海德格以前的學生與情婦。儘管她寫文章批評他，儘管已經有許多種族滅絕屠殺的證據被揭露，儘管她知道他的一切，並且抱持質疑態度，但漢娜內心無法抗拒這位昔日情人的魅力。
一九五○年二月，漢娜在內心劇烈掙扎與自我懷疑之下決定去見海德格。漢娜在二月七日抵達佛萊堡立刻給他一封短函，建議他到她下榻的旅社見面。海德格沒有預先通知就在傍晚六點半抵達，漢娜又一次被他的魅力征服。「當服務生報出你的名字時，」她之後對他說：「時光彷彿突然凝結了。」令人大感意外，漢娜安慰海德格，她之所以這麼長時間和他斷絕聯絡，純粹因為她的尊嚴，以及她「徹頭徹尾粗魯不文的極度愚蠢」，而不是其他原因；換句話說，並不是在意他與納粹黨沆瀣一氣的那段過往。
可是海德格早已成為納粹黨徒了。在他擔任一級大學校長重要位置時，已經迫害許多猶太裔學者，並反對納粹體制人士的學術生涯，有時甚至摧毀他們的人生，遭此下場的還包括一位虔誠的天主教徒。當雅斯培的猶太裔妻子遭受納粹政權迫害，有生命危險時，海德格連指頭都沒動一下。在少數幾個例子，他的確幫助受欺壓迫害的猶太人，但是他這麼做是基於和這些人的友情，並不是出自對納粹政策的憤怒。第三帝國建立初期，海德格就仔細拜讀、領略《我的奮鬥》，特別是書中對猶太人的憎惡。海德格和希特勒一樣，對於「國際猶太人集團的陰謀」深信不疑。早在一九二九年，他寫給一名官員的信件裡就提出警告：「我們面臨一個選擇的時刻：在吾德意志人民的精神生活中，究竟要帶入純本土的教育工作者和勢力，或最終放棄一切，在大小層面都開始猶太化。」
