迎接2015年元旦，總統府前舉行升旗典禮，除正副總統及行政、立法院長參加，新科台北市長柯文哲也首度出席。典禮開始前，馬英九總統趨前向柯文哲握手致意，圍著國旗圍巾的柯文哲還揮揮手上的小國旗。升旗時，馬英九與柯文哲兩人都開口大聲唱國歌。
在馬英九上台致辭時，現場突然出現獨派團體，高喊「還我人權，青年救扁」，抗議前總統陳水扁未能在新年前保外就醫，與現場民眾發生衝突。而前晚表示將參加升旗典禮的前副總統呂秀蓮，則因為凌晨時身體不適送醫急救而未能出席。
總統府前升旗典禮依慣例在元旦清晨6點半開始。馬英九率副總統吳敦義、立法院長王金平及行政院長毛治國一同出席；而首次參加的柯文哲到場後也一一與吳、王、毛等人握手，一舉一動備受矚目。
典禮開始前，馬英九趨前一一向出席官員握手致意，也主動與柯文哲握手；和其他官員一樣圍著國旗圍巾的柯文哲，也對馬英九揮揮手上的中華民國國旗致意。
唱國歌時，馬英九和柯文哲一同張開口大聲唱；而在升旗時，馬英九則和平常一樣一邊行舉手禮，一邊隨音樂唱出歌詞，柯文哲則是行舉行注目禮，並未同唱。
儀式完成後，馬英九隨即發表簡短談話，肯定2014年台灣經濟好轉，訪台觀光客人數超過990萬。在馬英九致辭之際，現場突然有獨派團體高喊「還我人權，青年救扁」，抗議法務部未能在2014年除夕准許陳水扁保外就醫，引起觀禮民眾怒斥「神經病」，還有民眾高喊「柯市長，管一下」，現場爆發叫罵衝突。
