媒體報導菲律賓來函，有意採認我國緊急使用授權（EUA），直接使用我國國產疫苗，在當地免做3期臨床、直接施打。但菲律賓總統發言人哈利・羅克（Harry Roque）接受《ABS-CBN新聞》時表示：「我否認這一點」。蔡英文政府力推國產疫苗，遭質疑被「打臉」。對此，總統府晚間發出新聞稿表示，菲律賓政府確實並未向我國提出疫苗的協助事項，菲律賓政府也未致函我國政府，整件事為有心人士混為一談，此無助台菲友好關係。
總統府發言人張惇涵說，國產疫苗廠商是否向菲律賓洽談實驗合作或採認EUA，以及菲律賓政府是否向我國提出疫苗協助等相關議題，部分有心人士將這兩件事混為一談，但事實已經釐清，非常清楚是兩回事。
府說明三點立場：第一，中央流行疫情指揮中心並沒有說菲律賓政府來函給我國政府，食藥署也明確公開表示，目前沒有收到菲律賓政府致函我國政府。部分媒體的報導，標題並不正確，指揮中心已經請相關媒體更正。第二，對於台灣疫苗廠商個別尋求海外合作實驗國家等事務，總統府沒有評論。第三、菲律賓政府確實並未向我國提出疫苗的協助事項，菲律賓政府也未致函我國政府。
張惇涵表示，即便事實已經釐清，很遺憾看到，仍有部分有心人士將兩件事混為一談，這不僅對閱聽大眾的正確認知沒有幫助，對於防疫工作也沒有正面助益；甚至，對於深化台菲雙方友好關係，也沒有正面效果。
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