畢竟日本不只在歷史上曾經侵略中國，而且還與台灣存在著釣魚台列嶼的領土主權之爭，李登輝及民進黨為了鬥爭老一代外省元老去美化日本統治的言行看在藍營支持者眼中已經超越政治鬥爭的界線。倒是中國大陸從90年代開始，逐漸拋棄毛澤東與鄧小平時代的親日政策，走上極端反日的民族主義道路，讓藍營支持者們逐漸把北京視之為共同反對台獨分離主義的盟友看待。
與「中國」脫鉤的中華民國
2000年的第一次政黨輪替，從各方面看都是台灣政治史上的一個分水嶺。主張台獨的民進黨上台，讓過去堅決捍衛中華民國體制的藍營群眾第一次認知到中華民國不只是可以換黨執政的，而且還可以成為台獨分離主義勢力的「遮羞布」。如果說90年代與中國大陸的合作，還只是共同抗擊分離勢力與日本軍國主義的復活，那麼政黨輪替顯然讓藍營支持者認知到中華民國有可能「不再是自己的」。
中華民國的旗號、憲法與圖騰被以陳水扁、呂秀蓮為代表的分離主義者「借殼上市」，意味著「中華民國等同於中國」的概念徹底破產。多數藍營支持者雖然嘴巴上不願意承認「中國等於中華人民共和國」，仍堅持以「中共」或者「大陸」稱呼對岸，但是此刻他們心裡已經沒有人相信「中華民國等於中國」這套由兩蔣父子建立的法統概念。
淪為在野黨的中國國民黨，雖然一改過往「漢賊不兩立」的政策，轉而積極在民進黨執政的情況下擔當台獨剎車皮的角色，試圖維持兩岸關係的穩定，卻仍從爭取選票的角度出發，盡可能淡化自身的「中國」色彩。此一舉動更加強化了藍營群體「中華民國不等於中國」的認知，轉而默默接受「中華人民共和國等於中國」與「中華民國等於台灣」的兩岸現狀。
在確認了「中華人民共和國等於中國」後，認同中華民族主義的藍營支持者轉而不排斥，甚至在相當層面上認同起了中華人民共和國起來。主張中華民國民主制度為優先的藍營支持者，則轉變為「永久維持現狀者」，甚至於「獨台」或者「華獨」的支持者。此刻「討厭民進黨」，又成為了將兩股藍營分裂勢力團結在一起的共同信仰。
而連戰在2005年對北京的造訪，則被藍營支持者中的「中華民族派」視為「第三次國共合作」的開端，他們不再像過去一樣對「中共同路人」的標籤避之唯恐不及，而是將在台灣為中共體制辯護視為自己，乃至於整個泛藍陣營應有的「民族責任」。至於「中華民國派」，則在「討厭民進黨」的優先考量下暫時壓制自己內心的反共情緒，與「中華民族派」共同實現了2008年的二次政黨輪替。
令藍營群眾失望的中華民國
馬英九上台後，對外推行「親美、友日、和陸」政策，試圖在美國和大陸日益激化的對立中維持戰略平衡。對內他則試圖當全民總統，同時滿足藍綠兩大陣營的意識形態需要。一方面他積極出席二二八事件的相關活動，試圖以真誠道歉的態度撫平台灣的族群對立。二方面他積極與大陸爭奪對日抗戰的話語權，試圖重建「中華民國等同於中國」的法統，以恢復「中華民族派」對台灣的信心。
