第二天上午的會議則是一開始便充滿緊張和期待的氣氛，當討論政治任務案而進行發言時，非主流的丘衛邦等人的發言，遭到坐在第五區位置上的中南部黨代表的強烈噓聲，有人大罵：「你混蛋。」並起哄要其下台，擔任會議主席的林洋港雖然事先曾要求大家要包容不同意見的聲音，但對此情況也無可奈何。
異議論者都遭修理
接下來的重頭戲，黨內總統提名辦法三案並陳，主持的李元簇先是放寬發言人數從五人增為十人，據黨部指出，李元簇在會前並認為，由於是採抽籤發言的方式，如果抽到的都是贊成黨代表方案的人發言，則他將再多抽幾名不同意見者，讓他們的聲音也可以出現，結果十人中共有八人主流派，二人非主流派，主流派輕易又下一城。
非主流在這樣的情況下，就只有一些零星的炮火來「點綴」普遍擁護主流派的會場。立委王天競被抽到發言時，他表明支持黨員直選，也講了像「國民黨如果分裂，主席要負很大的責任」這樣的話，而當他還沒有發言完畢時，就有很多黨代表在座位上大叫，要他下來。像立委丁守中在大會前就一直發表著請李登揮退下來，由中生代接班的論調，大會第二天在討論黨務時，也被黨代表陳玉蘭發言修理。
在決定提名辦法時，第一波對決開始，黨部這時拿出一份由台北市議長陳健治等八十餘人連署，要求以舉手表決的方式決定提名辦法，李元簇於是詢問是否有異議，丘衛邦等人馬上要求以無記名投票方式，非主流部分人士此時情緒十分激動，李元簇還一度指著丘衛邦大喊：「不要動。」現場秩序才漸漸平靜下來。
結果有二七六人附議丘衛邦的提案，超過一百人的底線規定，於是就該案再進行表決，但僅有三○三人贊成以無記名祕密投票方式決定，未過半數，舉手表決方式遂告確定。
但第二波戰況便趨平靜許多，第一案的中央委員票選案竟還有二十人舉手支持，而第二案的黨代表案則一舉獲一三八五人的支持，超過在場人數一九六九人的過半數，主流派攻下最重要的一役。主席臺上除李元簇外的高級黨工全部舉手，行政院長連戰也舉手，李登輝本人則並未舉手。此時全場是一片旗海和歡呼聲。
梁的發言措詞強烈
梁肅戎又說，希望李主席對黨內善意的不同意見要容納，「不是我危言聳聽，這個黨已經分裂了，你看現在兩位黨副主席不在這裡，早上表決時有三百多個黨代表不支持你……」，「這恐怕不是你個人勇氣能解決的問題」。
李登輝在閉幕致詞時，再度呼籲黨內要團結，十四全也近尾聲，但是李登輝的宣布參選，則是為整個會議過程掀起最熱烈的高潮，從四、五個月前便已決定參選的意向，李登輝卻號共僅一○八個字，簡單的宣布他參選的決定。他說，這是經過「長期慎重的考慮」，「懇請各位代表同志支持，謝謝各位」。此時全場幾乎全部起立鼓掌，而非主流的人馬則坐在位置上冷冷的看著這幅冷暖在心頭的畫面，郝柏村及林洋港也一直到李登輝下來和他們握手時才緩緩起身，但皆面無表情。
