交通部原規劃端午疏運期間採差別管制收費，且縮減其中兩天免收費時段，遭多位立委反對，要求恢復0時到6時免收費時段，交通部長賀陳旦當時拒絕讓步，但高公局25日發布新聞稿，表示4天連假的免收費時段將統一為0至5時。
交通部原規劃端午疏運期間，5月27日、30日凌晨0時到5時，28日、29日則縮減到5個小時，僅上午3時到5時暫停收費，並採差別管制收費；賀陳旦22日在立院交通委員會質詢時遭眾多立委質疑，不過當時賀陳旦指出，國道夜間肇事率是其他時段的3倍，隔日甚至親上火線向媒體說明政策初衷，卻仍難以說服社會大眾，政策在25日急轉彎。
高公局聲明，端午連假深夜暫停收費時段，是依據車流特性作差異管制，雖多次說明，但社會大眾仍對「一假兩制」感到混淆，以致「曲解減短免費時段之用意」，為施政簡明，決定從眾如流，將四天連假暫停收費期間統一為0至5時。
高公局也呼籲，各項疏運措施對國道安全及順暢，有賴廣大用路人共同維護，國道行車務必養足精神再上路，切勿疲勞駕駛。
