但儲存場曾於1991年發生核外洩事件，1994年也發現有4000多個貯存桶有鏽蝕問題，於是在1995年，時稱雅美族的達悟族人所發起之正名運動中，就明確要求台電須於2002年前將核廢料全部遷出蘭嶼。
而原能會考慮到蘭嶼潮濕高溫的氣候，在1996年便要求台電需要對廠區內的貯存桶進行整修作業，台電也於同年10月修訂「低放射性廢棄物桶檢整重裝作業點」，並於1997年2月14日公告實施，2001年台電將回饋金2.2億元交予蘭嶼鄉公所，承諾每3年會編列1次回饋金，台電並於2007年9月發包整修作業，同年12月開始整修工程，最終在2012年6月結束整修工程，恢復靜態貯存狀態。
定期採集水、土壤 原能會：蘭嶼放射線在安全值之內
根據原能會輻射監測中心表示，現已加強蘭嶼地區全面性的環境輻射監測作業，確保輻射安全，監測項目包含環境中的直接輻射量，也會定期採集民眾飲用水、地下水、海水、土壤、岸沙與農漁產等樣本進行監測，每年樣本量超過500個，經調查後，歷年蘭嶼的放射線背景值約為每小時0.027至0.041微西弗，都在背景輻射自然變動範圍的中每小時0.2微西弗以下。
物管局並也要求台電公司在各部落建置環境輻射顯示裝置，並且把即時資訊公布於網路上。
經濟部於2012年時就曾經核定台東達仁與金門烏坵作為核廢料的最終處置場，但是迄今仍無法完成公投，而台電也因為無法找到最終處置場場址，在今年7月遭原能會開罰1000萬。
台電強調，將來會在我國的無人島或是準無人島興建「集中式貯存場」，位於蘭嶼的核廢料將會於第1期優先轉移存放。
