西南運輸處受國際運輸統制局監督指揮，該處擁有貨運大卡車二百餘輛，每次所運貨物，皆用財政部印製的封條貼在貨品箱上，沿途軍警機關即免予檢查。西南運輸處長林士良，係孔祥熙部長的親信幹部，據說他原係孤兒院出身的，由孔資助他完成學業，再入財政部任事，人亦聰穎，深得上峯信任，孔夫人亦深喜之。
民國三十三年正是仰光被日軍佔領，我國抗戰吃緊，重慶大後方物資最缺乏之秋，而市面上各種外國奢侈品琳瑯滿目，公開出售，始以為係美軍方面拋售出來的，經查明不確。蓋美軍的軍用物資種數有限，只是香菸啤酒之類，若男女衣料絲襪暨婦女化裝品以及打火機等等，是少有的。戴雨農的情報工作很嚴密，知道這都是由西南運輸處利用職權，走私進來的。但未獲得證據，不便究辦。於是，他以國際運輸統制局監察處長身，親往昆明偵查。這時仰光失守，臘戍很危急，西南運輸處長林士良親自到臘戍搶運儲存該地的貨物。
某日，林以一百五十輛大卡車載運物資到昆明來，戴從長途電話中詢知這批卡車何時由臘戍開出，林士良親自押運等情況後，屆時帶同衛士在昆明車站上，等候大隊車輛一到，即隨車開至存貨的倉庫中，立即拆去封條，檢視全部貨物，大部分皆係走私的奢侈品，旋將林士良扣留訊究，以人贓俱獲，無從狡賴，乃據情呈報重慶最高當局，請將林置之大辟，藉伸法紀，而渝方大員為林士良緩頰的電報紛至沓來，孔部長且電令戴 他兼任財政部緝私署長 著將林押解重慶處理，不得違誤。戴知若將林解赴重慶，勢必不了了之，即將林槍斃，覆電孔謂奉到電令時業已將林處決了！
消息傳播後，各方人士初則震驚，繼則稱讚戴此項非常舉動，足以廉頑立懦，戢止貪風。然孔已為之大怒，指戴抗命擅殺政府要員，非同小可。戴回渝晉謁財孔，報告本案經過時，孔夫人曾斥責道：「戴笠，你有幾個腦袋？」其忿慨可知。既而孔乃下令裁撤「財政部緝私署」，戴兼任署長已久，經手公帑亦多，倉猝移交，措手不及，然又無法挪移「軍統局」公款濟急，因該局經費係由中樞派遣經理處長綜持的。他怕授人以虧欠公款、移交不清的罪名，只好四出張羅，幸得杜月笙大力幫忙，才使緝私署的移交辦妥，未出紕漏。
林案發生後，外間忽有訛言流傳，謂戴之敢於處決林士良，背後必有特殊力量支持他，否則不致如此大膽。未幾，香港廣東銀行總務處長鄧勉仁由港赴渝，臨行有人祕密託他帶信交給渝方要員，內容是談中日停戰言和問題。蓋此時日本軍閥自知必敗，急求中日和談，曾挽周作民向渝方要人接洽。鄧勉仁原係毫無政治知識的純粹商賈之輩，以為帶一信到重慶，無關宏旨。他到達渝市時，原信即被檢查機構查獲了，認有通敵嫌疑，報告戴笠處理。廣東銀行的董事長是宋子文，於是，即有人對戴說：「孔部長手下的人走私，你將他殺了，宋部長手下的人通敵，看你怎麼辦？」戴為澄清訛言，報請最高當局核准，即把鄧勉仁執行槍決！實則林士良案發生時，宋子文正在美國公幹未歸。
