病友團體參與「全民健康保險藥物給付項目及支付標準共同擬訂會議」，被賦予法源地位是依全民健康保險法第41條之規定－「醫療服務給付項目及支付標準，由保險人與相關機關、專家學者、被保險人、雇主及保險醫事服務提供者等代表共同擬訂，報主管機關核定發布。藥物給付項目及支付標準，由保險人與相關機關、專家學者、被保險人、雇主、保險醫事服務提供者等代表共同擬訂，並得邀請藥物提供者及相關專家、病友等團體代表表示意見，報主管機關核定發布。」（前二項標準之擬訂，應依被保險人之醫療需求及醫療給付品質為之；其會議內容實錄及代表利益之自我揭露等相關資訊應予公開。於保險人辦理醫療科技評估時，其結果並應於擬訂前公開。）
我國的「新藥收載給付流程」在進入二代健保時代以後，陸續有新的變革，最大的改變就是從原本一階段式的「專家會議審查」變成兩階段式的「共同擬訂會議決策」。再者，病友團體可列席共同擬訂會議的基礎，也是歸列在全民健康保險法的架構下。因此，新藥收載給付決策過程納入公民參與或是病友團體聲音，是二代健保變革後的基本精神。
再者，醫療科技評估考量醫療倫理之聲浪，其法源依據亦來自健保法第42條－「前項醫療服務給付項目及支付標準之訂定，保險人得先辦理醫療科技評估，並應考量人體健康、醫療倫理、醫療成本效益及本保險財務；藥物給付項目及支付標準之訂定，亦同。」
在上述的法源基礎架構下，醫療科技評估始有「病友參與」之聲浪，健保署為擴大民眾參與醫療科技評估機制，亦在健保署網上設立「新藥及新醫材病友意見分享」平台，此平台主要目的為，針對欲申請給付之新醫藥品，在提共同擬訂會議前，先蒐集病友對該醫藥物之使用經驗，健保署亦將收集後之意見彙整供共同擬訂會議決策參考。
健保署於2011年公開第一份醫療科技評估報告，這是醫療科技評估走向公開透明的第一步。2013年二代健保推行之後，在健保法的基礎架構下，醫療科技評估報告亦加入醫療倫理等議題，但礙於國內可參考之資料有限，醫療倫理之議題並無著墨太多。從2011年至今，健保署在其網站上公告了約119份醫療科技評估報告。但若無適度宣傳，醫療科技評估在諸多公眾政策議題當中，可能仍無法普及大眾，更遑論自己的權益自己顧的公眾參與目標。
蔡英文總統上台後，我國公民參與的聲浪轉成一種基本定調的共識，關於國內各項與大眾權益相關的建設，陸續都有「自己的政策自己救」的聲音。當公民欲開始參與涉及高度專業的臨床證據或醫療相關議題，其培養公民或是病友團體有足夠的基本知識瞭解「健保新藥收載給付流程」或看懂「醫療科技評估報告」，實為目前醫療衛生政策之重要課題。 （相關報導： 觀點投書：臺灣健保醫療科技評估制度的執行省思及建議 ｜ 更多文章 ）
健保新藥收載給付流程導入醫療科技評將近10年，這10年來，大部分民眾或是病友團體，對醫療科技評估相關制度仍相對陌生，醫療科技評估也未普及成眾所皆知的公民知識或常識，其主因為，醫藥相關議題涉及高度專業之知識，若需將高度專業化的知識轉化成「大眾、平民語言」，對執行醫療科技評估者的研究人而言亦是一種挑戰。若二代健保的基本精神是擴大並普及讓公民、病友參與，那麼醫療科技評估執行者則有其義務使用大眾式的平民語言宣傳醫療科技評估制度。政府部門若須讓更多公民或病友團體參與並瞭解醫療科技評估，則有以下幾點建議：
