國史館23日發表《二二八事件檔案彙編》，中央研究院近代史研究所副研究員陳儀深說，二二八事件蔣介石要負最大責任，鐵證如山，「該處理中正廟轉型問題了」，他希望能夠在總統蔡英文的執政時期看到，有關中正紀念堂或其他不義遺址的處理。
陳儀深表示，前總統陳水扁執政時，2006年二二八責任歸屬報告出爐，2007年時陳水扁才去處理中正紀念堂的轉型。幾個月前他剛好有機會問到陳水扁當初怎麼處理得這麼慢，陳水扁回答：「你們的報告2006年才出來，2007年做怎麼會慢？」他認為這樣說法也有道理。陳儀深接著說，在蔡英文執政時代，落實轉型正義的事情當然要趕快做，因為這是蔡英文的五大政見之一。他也強調，除了處理不當黨產外，中正紀念堂或其他像不義遺址的處理，希望能夠在蔡英文的執政時代看到。
陳儀深說，「我們寫過的很多就是真相，就看要不要面對，要不要接受而已」，有了歷史真相後，要如何推動轉型正義還是需要意志、決心。不可能等到99%贊成後才去推，要有一定的自信。他也強調，崇拜單一偉人這件事，不適合在台灣、在台北市、在民主國家，可以叫人權博物館的總館，也可以把它改為歷任總統文物館，都有人這樣建議。
