然而雖說全球化給運動帶來新的面貌，卻始終無法破除主流與邊緣之分。自20世紀以來，原教旨主義幾乎壟斷了伊斯蘭復興運動的話語權，表現形式也日趨政治化，某些國家開始制度性地要求人民遵從伊斯蘭法與儀式，將伊斯蘭自由主義、新蘇菲主義等其他復興運動的勢力擠向角落。在這波潮流下，穆兄會雖長年處於被埃及政府查緝的狀態，卻仍有自己的生存之道。
穆兄會為何屹立不倒
1928年，埃及伊瑪目哈桑·班納創立了穆斯林兄弟會（簡稱穆兄會），這個組織原先主打降低文盲人口、伊斯蘭社區服務等理念，卻在要求知識份子支持時產生了質變。穆兄會原本的據點是蘇伊士運河所在地西奈半島，然而當組織成長到一定規模，滲入開羅、亞歷山卓等大城後，穆兄會的成員開始有意識地削弱宗教話語，並轉為學習反殖、民族主義等能讓知識份子感興趣的論述，再加上班納的個人魅力強大，故一下讓穆兄會的規模擴大不少。
當穆兄會逐漸政治化後，其理念也由社區服務進階到成立烏托邦，例如班納曾說穆兄會的終極目標，是要驅逐所有殖民者，建立一個從西班牙到印尼的伊斯蘭帝國，並恢復哈里發制；然而對於帝國該如何實行內部統治，穆兄會雖以伊斯蘭法為依歸，卻又認為官僚的形式主義相當僵化，不可完全依靠；另外在性別議題上，穆兄會站在了保守的一方，認為女性權益雖值得保障，卻始終跟男性不同；而在宗教事務上，穆兄會則曾表示過，應該取消科普特人興建教堂的權利，這導致莫爾西上任後便飽受國內科普特群體的排斥，為其倒臺種下禍根。
兄會的參政路以反殖為起點，由傳道走向武裝鬥爭，除了燒毀劇院、咖啡館外，也暗殺埃及政要。然而1952年自由軍官組織推翻法魯克王朝後，穆兄會本來期盼軍方能跟自己一同分享權力，畢竟其為支持革命也算出錢出力。結果軍方上臺後卻獨攬大權，於是雙方互鬥更為激烈。1954年政府以穆兄會＂暗殺納瑟總統未遂＂為由，開始了迫害的進程，數以萬計的成員入獄、遭受酷刑，領導紛紛流亡海外，穆兄會一夜回到革命前。
然而當1967年埃及輸掉六日戰爭後，風向似乎就變了。在戰後的檢討中，開始傳出＂以色列之所以能贏，是因為猶太人的信仰比阿拉伯人虔誠堅定＂等聲音，曾被壓抑的宗教話語終於又浮上檯面，吹響新一波伊斯蘭復興運動的號角，這次的規模遍及全球，造成泛阿拉伯主義、納瑟主義、阿拉伯社會主義的衰退，也促成穆兄會的重生。
其中，埃及政府也扮演了令人玩味的角色。當年沙達特因匆匆由副總統扶正，又缺乏納瑟那樣的強人魅力與威望，故執政之初屢遭軍方內部其他將領的掣肘。於是他借力使力，在伊斯蘭復興呼聲正高時對穆兄會示好，允許海外流亡幹部回國，既為自己增加許多教士階層的支持，足以震懾同僚的野心，也為穆兄會的政治化點燃新的火種。
