「大學系統」的觀念來自美國。但橘越淮而為枳；就如其他許多的舶來觀念一樣，大學系統在臺灣的實施是空有其名。
臺灣引進大學系統的法源，始於2005年版全文修訂《大學法》的第六條。之後教育部於2010年5月6日修訂的《大學系統組織及運作辦法》第三條規定：「組成大學系統之各學校，保有自主性與原有權責，並在大學系統合作架構下，整合系統內學校之資源，……。」
該《辦法》第五條規定「合作及整合」項目，包括：招生、開課、跨校修讀博士學位、相互轉校、共享資源、教師流動等等。至於系統的組織，該《辦法》第六條規定：「置系統主席或系統校長一人，由系統內各學校現有人員兼任」；第七條規定「設系統委員會，由系統主席或系統校長召集」。
於是，自2003年迄今，臺灣的諸多大學共組成了七個「系統」及七個「聯盟」，[1] 基本上反映了臺灣大學數量之多！[2]大學系統與大學聯盟的名稱雖異，但性質相同，也都經教育部核定。七個大學系統是：「臺灣聯合大學系統」（「臺聯大」，4所大學）、「臺灣綜合大學系統」（「臺綜大」，4所大學；2008，2011）、「臺北聯合大學系統」（「北聯大」，4所大學）、「臺灣教育大學系統」（「臺教大」，7所大學）、「中臺灣大學系統」（6所大學）、「國立臺灣大學系統」（3所大學）、「臺灣國立大學系統」（11所大學）。
七個大學聯盟是：「泛太平洋大學聯盟」（6所大學）、「國立臺北專業大學聯盟」（4所大學）、「優久大學聯盟」（13所大學）、「雲林國立大學聯盟」（3所大學）、「明志長庚聯盟」（3所大學）、「臺灣海洋聯盟」（三所大學）、「彰雲嘉大學校院聯盟」（15所大學）。
不管是名為大學系統或大學聯盟，臺灣的這些組織與外國的所謂「university system」大異其趣，都只能算是「校際合作組織」（inter-university cooperation）或「合夥」（consortium）；其主要功能不外是促進合作。
其實臺灣諸大學歷年來已組成四個向政府立案的協會（associations）——私立大學校院協進會（APUC, 1994）、中華民國國立大學院校協會（ANUT, 1998）、私立科技大學校院協進會（APUCT, 2002）與中華民國國立科技大學協會（ANUST, 2012）。此外，大學校長們每年還參加種種會議，諸如大學校長會議、大學招生委員會聯合會會議、全國師範／教育大學校務聯繫會議等等。試問：既然在各種場合中都已有機會討論合作事宜，何須再營造「小圈圈」？何況，非屬同一系統的大學也可合作的——各種校際合作事項都有相關法規可依循。 （相關報導： 風評：卡完管中閔卡盧業中，民進黨有完沒完？ ｜ 更多文章 ）
說實在的，不成立大學系統，也無妨於大學間的各種合作。那成立系統有何需要呢？最明顯的「好處」是：大學系統可毋需經過遴選委員會的程序，而拱出一位「系統主席」或「系統校長」來，「綜理系統校務與聯合發展相關事宜」——給名也給辦公費；各相關大學甚至還可多任命一位「系統副校長」。這些名位並無明確的法定權責，因而所能發揮的功能實在有限。總而言之，歷年來教育部根本就不認識「大學系統」之為何物；而各大學趨以為風尚，多附和盲從——似乎若不參加小圈圈，就顯得孤立。
