「他們為什麼捂蓋愛滋病疫情，自有其不可告人的情節。我更想探個水落石出，這促使我再進一步下鄉調查愛滋病疫情，」高耀潔寫道。
在高耀潔國際聲譽日漸增長後，河南當局多番阻撓她出國接受領獎。2007年在她前往美國領取「生命之音」頒發的年度女權活動人士獎以前，由於河南當局阻止她前往北京獲得簽證，將其軟禁，最終只有在時任美國參議員希拉蕊·柯林頓（Hillary Clinton）為此致信中國國家主席胡錦濤及總理溫家寶後，高耀潔才得以被放行。
2009年，在法國駐華大使館電話告知她被該國授予「傑出婦女獎」之後不久，5月6日，她的電話與電腦出現問題，同時她發現小區內出現許多陌生人。由於擔心手中的愛滋病資料與書稿會有危險，她當即將電腦硬碟藏在內衣兜內，離開了位於河南鄭州的家。
「我權衡了利與弊，我想，本人若無聲無息地死去，我手裏的資料便石沉大海，而且外界一無所知，」她在2013年回憶自己出走的決定時這樣寫道。
在其美國友人的幫助下，她在2009年8月8日抵達美國，從此開始了她的流亡生涯。
高耀潔在紐約的生活依舊圍繞中國愛滋病疫情。她出走時在硬碟中帶出的三本書稿在抵達美國後全部得到出版，她也舉辦多場講座，介紹中國愛滋病疫情的歷史。
「她不是第一個把中原血禍說出來的醫生，卻是捅出這個消息之後（1996年），連續14年堅持不懈、遭打壓而絕不倒下的人，」中國歷史學者朱學勤在高耀潔2011年出版的《我的防艾路》一書序言中曾這樣寫道。
力量源泉
高耀潔的一生伴隨中國近現代史的歷史起伏歷經多重轉折。林世鈺認為，支撐高耀潔的力量源於她小時候受到的儒家教育。
1927年12月，高耀潔出生於山東曹縣一個富裕家庭，是家中長女，從小被過繼到無子女的大伯母徐氏膝下。雖然她也受到了裹腳等中國社會對女性傳統要求的束縛，但卻也養成了仁愛、獨立的性格。
據高耀潔回憶錄記載，徐氏出身文人世家，父親為前清進士，曾為光緒皇帝之師。在徐氏身邊，高耀潔學會了認字，還被送去私塾念四書五經。
「那幾年對她影響很大，」林世鈺表示，高耀潔從小受儒家修齊治平的思想灌輸，見到家裏人每到災年便打開糧倉救濟鄉親等場景，在耳濡目染下學會要努力幫助他人。
「她對我說，人和人就是要互相幫助，不能光顧自己的那點事情。她說她自己平生無大志，但求吃飽飯，並且在自己吃飽飯的同時也要讓別人吃飽飯，」林世鈺稱。
