衝壓引擎的原理，是透過高速的迎面氣流加壓，但是當飛彈在高空以六倍音速巡航時，彈體與空氣摩擦產生的溫度將近攝氏兩千度，研發難度極高，當時僅有英、美、俄、法這四個國家能夠做到，可說是高度機密的技術。
面對難以獲取設計參數等資料的困境，蘇玉本幾乎後半輩子都沉浸在這個領域中，帶著團隊致力突圍，終於讓台灣成為全球第五個研發成功的國家。而被譽為「航母殺手」的超音速反艦飛彈雄三，便是採用衝壓引擎做為續航推進系統，使得飛行速度大幅提升，在兩岸的對峙情勢中，高度提升了台灣的國防實力。
科學只有對錯，沒有階級
面對前所未有的研發挑戰，蘇玉本為何能帶著團隊突破多項關鍵技術？他將功勞歸於團隊，銘記眾志成城的力量，「我的角色，就是做好系統整合的任務。」
蘇玉本巧妙譬喻，即使將世上最完美的眼睛、鼻子、嘴巴等器官組合起來，也可能出現比例失衡的現象，衝壓引擎的研發也是如此，進氣道、燃燒室、供油三大組成之間的零件設計，可能出現互相衝突牴觸的情況。要能達成最佳平衡，便有賴蘇玉本站在制高點，進行取捨與判斷。
在這個過程中，蘇玉本致力於創建讓每個研究員都能暢所欲言、直抒己見的風氣，就像他自己剛進入中科院時，即便只是一個初出茅蘆的小伙子，也能與資深同事平起平坐，即便爭得面紅耳赤，彼此之間也不會留下心結。
「工程問題只有對錯，沒有階級」是蘇玉本時常掛在嘴邊的座右銘。不過，一旦取得共識、拍板定案，他就會要求團隊必須服從紀律，朝共同目標使力；即便中途出現失敗、士氣低落，他也一直傳遞「工程沒有一次就成功」的經驗，帶著團隊快速振作，重複無數次運算修正的循環。
每一次的飛彈試射，背後都是團隊數年的努力，以及高達千萬元的資金投入，「試射演習失敗，被批評嘲諷是『天女散花』的時候，也會很挫敗，」蘇玉本半開玩笑地說，這是造就他心律不整的病根。然而，正是在一次次的實驗、除錯中，鍛鍊出蘇玉本敗而不餒、百折不摧的堅強意志力，奠定中科院在火箭飛彈系統領域的領先地位。
帶領中科院轉型突圍
一九九九年，蘇玉本接任中科院第二研究所所長，適逢冷戰結束，過去不能獲得的武器也開始能透過採購輸入，導致中科院遭受預算大幅刪減的衝擊。此時的中科院面臨轉型的迫切需求，才能找出永續經營的生機。
在斷炊危機之下，蘇玉本召集高階主管們共同腦力激盪，重新訂出「顧客滿意、締造雙贏、團隊合作、建立尊嚴、技術創新、追求卓越」的新策略。在配合國家布局、開展國防自主之外，他更積極讓中科院「走出去」，一方面強化與工業界的互動，同時也想辦法開拓財源，包含在三年內推動超過百件的國防技術移轉民間的技術服務案、爭取經濟部科專計畫。
