這段過程，蘇玉本看得很清楚，過去多年的超然戰略地位讓中科院難免帶有一種「衙門氣息」，內部不同單位間的協作流程複雜冗長，不只拖累了研發創新的步伐，也不利於對外合作的推進。
因此，蘇玉本在工作之餘，不時前往企業參訪、向經理人取經，並率先在中科院導入企業化管理觀念，推動作業流程電子化、主管任期制度、品質經營等新制，尤其是重視客戶意見調查，「我們做出來的東西，要能夠讓顧客滿意。」
蘇玉本口中的「客戶」，不只是針對外部單位，更包含所內人員。他解釋，中科院的人員組成大致可分為「支援」及「研發」兩大類，過去科技、文書、主計、行政等不同專業的人員互不了解，也產生了許多溝通上的誤解。
在新制改革下，蘇玉本期許，每個人都要以「全方位工程師」自居，將彼此當成是互相的顧客，想方設法簡化作業流程，提升服務品質與效率。
舉例來說，過去研發人員領取材料時，要填寫繁雜的表單，還要耗費很長的時間等待，在物料組重新調整流程之後，研究人員只需要上網申請，就會有人將所需材料送到，可謂是服務到家。
就連蘇玉本身為所長，也必須努力提升內部顧客⸺即所內同仁的滿意度。他規劃了「所長信箱」，讓有意見想要反映卻不擅於當面溝通的同仁也能自在表達意見，讓問題獲得處理。
諸多創新做法，蘇玉本不只要說服長官從事正確的方向，還要承擔從無到有、不知是否會成功的心理壓力，但是，從工程研發到組織管理，他都秉持同樣的態度，不計個人成敗、奮戰到底，為歷史悠久的中科院注入煥然一新的活力。
即便蘇玉本已經退休，曾經營造的精神持續影響至今。當蘇玉本獲得院士之後，採訪團隊提出希望在中科院進行拍攝的需求，中科院公共關係室團隊也特別向長官溝通爭取，讓原本需要耗費數月才能定案的申請流程，在短短一週內就順利通過，「這就是服務精神的展現，」蘇玉本欣慰地說。
憑藉著對於台灣軍事戰備尖端科技發展的巨大貢獻，蘇玉本在二○二二年七月，成為中研院第三十三屆十九位新科院士之中的一員，也是繼「雄風飛彈之父」韓光渭之後，第二位中科院出身的國家院士。
但是，若想要進一步了解蘇玉本過去的經歷，網路上可找到的公開資料卻寥寥可數。對此，他表示，因為涉及國際機密，在中科院工作的第一要務就是低調，很多重要成果也不能發表，自然無法獲得即時肯定。「我現在能講的，都是二十年前研發、已經解密的成果，」他指著中科院研發展示館大廳中的雄三飛彈與後方的天弓三型飛彈補充說明。
在漫長的研究生涯中，蘇玉本很耐得住寂寞，因為他從未想要追求掌聲，「想要功成名就，你就不應該在中科院工作。」
