距離海鮮市場只有幾英里的武漢病毒研究所被下令銷毀病毒樣本，不准再和合作的德州實驗室美方研究人員分享資料。中國軍方派出首席流行病學家和病毒學家陳薇少將接管武漢病毒研究所。曾經貼出未經批准的病毒訊息的研究人員、記者和醫師，都被逮捕和消失。
與此同時，病毒繼續擴散。李文亮─他是在社群媒體上貼出疫情而被逮捕的「八人幫」之一─也從病患身上染疫。他在病床上告訴《紐約時報》說，「如果官方提前公布疫情信息我想會好很多。應該更公開透明」。他在二月七日去世。
和SARS期間一樣，中國當局在新冠病毒流行之初，一致對外界提供錯誤訊息，也錯失在開始傳染之初就阻止其蔓延的機會。他們沒有警告人民這種病會人傳人，沒有更早禁止武漢人往外移動，沒有和國際科學界和外國政府分享資訊。
凡是研究過中國政府在SARS期間行為的人，對這些做法都不會驚訝，事實上都在意料之中。中共的特色本就是偏執狂、自我防衛心態、對事實和透明性不屑一顧。但這些缺點是第一次威脅到成千上萬美國人的生命。
北京的宣傳與勒索
在危機剛開始幾個星期，國務院和中方維持了頗為良好和建設性的溝通。國務院高度關注美國外交人員及其家人的健康，最後派出飛機將其撤離。這些飛機載有重要醫療設備給有需要的武漢醫院。中國也在搞對外援助攻勢。到了三月底，中國已對外援助一百二十個國家，發動了大規模的「口罩外交」。在一開始，中方的援助很受歡迎，但到後來，「口罩外交」變成中國以援助來逼人不要批評其錯誤處理新冠爆發的同義詞。
在川普宣布中國旅遊禁令後，美國政府和中國政府的合作大致上就終止了。中國政府害怕其他國家也會跟進譴責中國、傷害到中國經濟，於是北京發動全球攻勢，阻止其他國家對中國發布旅遊禁令。中國外交部長王毅在二月一日對印度外長說，中國「反對個別國家採取的渲染緊張、甚至製造恐慌的做法」。
當美國開始處理自己國內的疫情爆發，川普仍舊淡化其嚴重性。博明和納瓦羅請求川普要認真對待疫情，但習近平卻傳話給川普，讓他們的話起不了太大作用。
習近平和川普通了很長的電話，說服美方中國已控制住疫情，貿易協議也不受影響。白宮在這通電話後發布聲明說，「川普總統有信心中國有能力面對2019年新冠疫情的挑戰」。聲明還說，「兩位領袖同意雙邊繼續溝通合作。他們也強調美中第一階段貿易協議的巨大成就，重申要加以執行的決心」。但事實上，根據一名有參與這通電話的政府官員的說法，習近平在二月六日那天一直在提供假訊息給川普，通完電話後，川普對這場危機的看法就完全失真。
