而就在2020年「七一」前夜，全國人大常委會通過《香港國安法》，交香港特區頒布實施。7月底，香港特區行政長官林鄭月娥宣佈因新冠疫情，引用緊急法律押後原定於9月舉行的立法會選舉。陳皓桓於10月接任民陣召集人，岑子杰2021年1月因牽涉民主派立法會初選案，成為被起訴《香港國安法》「串謀顛覆國家政權罪」的47名被告人之一，被收押至今。
陳皓桓入獄前對BBC中文記者說：「我不認同民陣已經做不到以前做的事，當然我們無法舉行示威集會，難以叫大家一齊上街，但仍可做街站（街頭攤位），繼續找方法做事，例如《國安法》47人初選案，民陣都有發起群眾排隊進法庭聲援，都見到好多市民來法庭。」
隨著這位民陣秘書處「最後一人」入獄，民陣最終走到解散一步。
民陣解散的觸發點是什麼？
觸發這次解散的近因可追溯至3月5日，新加坡親政府的《聯合早報》引述匿名消息稱，此前網上流傳美國國家民主基金會（NED）曾資助民陣舉辦反修例活動，香港當局正調查此事，一旦證實屬實，民陣將因違反《香港國安法》而被特區政府取締。
該報還稱，民陣從未根據香港特區《社團條例》向政府註冊，一旦被判有罪，民陣負責人最高可被監禁三個月。
附屬中國國務院港澳事務辦公室的智庫全國港澳研究會副會長劉兆佳當時對《聯合早報》稱，泛民主派唯一的出路是改變路線，成為忠誠反對派，即願接受和尊重香港新憲制秩序、維護中國國家主權、安全和領土完整、拒絶勾結外部勢力等。
至3月中，教協宣佈終止參與民陣工作，數家香港媒體披露香港民主黨也已終止參與民陣工作。香港《明報》引述「民主派中人」稱，他們接獲「中間人」傳話，要是不退出民陣，就有機會受牽連，被指控違反《香港國安法》。
民陣成員團體由48個迅速減少至目前約10個，其中主要是激進民主派政黨社會民主連線及其衛星組織。實際上，民陣最後兩任正式召集人——岑子杰與陳皓桓——均為社民連核心成員。
社民連當時公開聲言不會退出民陣。
由中共直接控制的《大公報》、《文匯報》和《香港商報》，以及數份親政府的民營報章，此後接連發表指控民陣涉嫌刑事違法行為的報道與評論。3月20日，《大公報》聲稱有該報讀者向中國大陸「國家安全機關舉報受理平台」舉報，要求徹查民陣涉嫌「收受外國資金」或「勾結外國勢力」。
陳皓桓今年5月被判監前接受BBC中文專訪時說：「我會笑著說：『都說沒收過NED的錢，沒有試過。』我們民陣一直在街頭籌款，一直都是辦遊行，又怎麼個勾結外國勢力、收取外國資金呢？」
