這項提議已經招致各國宗教和政治領袖抨擊，包括東正教名義上最高領袖、君士坦丁堡普世牧首（Ecumenical Patriarch）巴爾多祿茂一世（Bartholomew I），以及正教徒人口超過9百萬的希臘都予以譴責。BBC報導，希臘文化體育部長曼多尼（Lina Mendoni）批評，土耳其的民族主義與宗教情節愈來愈狂熱，她認為該博物館既然已是世界文化遺產，不應該由一個國家的政府單位來決定此等重大改變。
聯合國教科文組織文化事務副秘書長歐同─拉米雷斯（Ernesto Ottone-Ramirez）也支持，改動該博物館需要更廣泛的認同。歐同-拉米雷斯說，聯合國已經去信土耳其詢問這件事，但還未收到任何回覆。
美國國務卿龐畢歐（Mike Pompeo）也警告，聖索菲亞博物館的地位有任何變更，都可能損及其「服務人類、作為不同信仰與文化間必備橋梁」的力量。美國國際宗教自由無任所大使布朗巴克（Sam Brownback）上周也呼籲，土耳其政府應該讓博物館保持原樣。
從沉默到力挺，博物館成政治工具
半島指出，艾爾多安掌權18年來，其實一直對聖索菲亞的地位未予置喙，他甚至曾經表達反對意見，叫倡議者「去坐滿藍色清真寺」。藍色清真寺是土耳其國家級蘇丹艾哈邁德清真寺（Sultanahmet Camii）的別稱，該寺就坐落於聖索菲亞博物館旁邊。
然而自2019年來，艾爾多安似乎大幅改變了心意，兩度在公開場合力挺改建回清真寺的主意。第一次是在2019年3月地方選舉前，當時艾爾多安領導的正義與發展黨（AKP）在伊斯坦堡的選情堪憂，極有可能輸給伊斯坦堡前市長伊瑪莫魯（Ekrem İmamoğlu）。
此外，美國總統川普（Donald Trump）當時也正好宣布將承認耶路撒冷為以色列首都，令穆斯林世界大為憤慨，艾爾多安抓住這次機會，宣布自己會將聖索菲亞博物館改建為清真寺，作為對川普的回應。尷尬的是，艾爾多安力挺的候選人最後還是輸給了伊瑪莫魯。
觀察家指出，艾爾多安再度提起博物館地位，可能是因為土耳其經濟貧弱不振，加上新冠肺炎疫情居高不下等因素，導致他的政治聲望岌岌可危。
厄德米爾批評：「艾爾多安兩次的呼籲時機，明顯都和國內政治考量有關，也是把聖索菲亞當成工具。」
不分立場皆認為「改建是內務，外國勿插手」
不過在土耳其，改變聖索菲亞用途的爭議已經上升至國家主權問題，許多土耳其人都認為這完全是國內事務，全力支持改建。就連反對改建的伊厄瑪茲也說：「這就是一件國家內政，國際勢力不該涉入。」伊厄瑪茲隸屬「共和人民黨」（CHP），是凱末爾成立的老牌世俗派政黨。
今年5月29日，艾爾多安與妻子特地在聖索菲亞舉行演講，慶祝「伊斯坦堡征服日」（İstanbul'un Fethi）576周年。同一個月，他還公開在電視訪問上強硬批評希臘：「膽敢叫我們不要改建聖索菲亞，是你們在統治土耳其，還是我們？」
艾爾多安還向其諮詢委員會表示，今年7月15日他希望在聖索菲亞館內舉行伊斯蘭教的晨禮，違反凱末爾所頒布、不准在館內進行宗教儀式的命令。2016年7月15日，土耳其軍方發動政變意圖扳倒艾爾多安政府，但24小時內就以失敗收場，艾爾多安政府將「政變未遂日」描述為「民主和團結」的國家節日，每年舉辦特殊活動茲以紀念。
聖索菲亞大教堂落成後，成為東正教會的神聖殿堂長達900年時間，僅在13世紀第四次十字軍東征時短暫中斷，當時歐洲基督徒橫掃君士坦丁堡，洗劫並強佔該教堂達50年，許多重要文物都被搬空。1261年，拜占庭人重新奪回教堂後才慢慢重建。1453年穆罕默德二世佔領該教堂，堅持將其改建為清真寺，派人移除裡面的東正教元素，並一步步增添上伊斯蘭式裝飾。直到1616年藍色清真寺落成以前，聖索菲亞都是土耳其最大的清真寺。
