《保防法》爭議，讓藍營找到攻擊蔡政府威權復辟的話柄，黨政人士透露，事實上，馬政府時期，調查局就一直在推動《保防法》，甚至還發動各地調查站用力遊說立委，只是當時被民進黨團檔下，但政黨輪替後，調查局長仍把馬政府時代就提出版本拿來推動，甚至在府院有意見時，發動各種人脈，試圖遊說蔡英文總統的核心幕僚，太搞不清楚狀況。
黨政人士說，馬政府成立廉政署後，當年一直私下反對廉政署的調查局當然吃味，而民進黨當時立場是反對廉政署，也被調查局視為可爭取支持對象，調查局提出此法，基本上就是有擴權的想法，當時調查局就積極遊說反對成立廉政署的綠委支持，但民進黨團仍為擴權疑慮太深，並未接受。
保安法版本是馬政府時代版？調查局：蔡清祥上台後開20多次提出的版本
黨政人士也說，雖然政黨輪替，調查局長改由檢察官背景的蔡清祥上任，但調查局仍然積極推動，基本上拿出來的草案，就是馬政府時代研擬的版本，但府院高層都有疑慮，當然不會接受，事實上，此法被時任政委的林美珠去年退回後，調查局不死心，又上呈一次，讓府、院很傻眼，當然還是退回。
調查局則說明指出，目前的保安法草案，不是舊版本，是總統到調查局演講時指示重視國家保後，相關局處開會討論二十多次後，重新提出的版本，和馬政府時代的版本不同。 （相關報導： 退保防法草案，行政院副院長林錫耀：有人權疑慮 ｜ 更多文章 ）
知情者也說，馬政府時調查局系統過去發動各地調查站，遊說立委支持，現在政黨輪替，調查局試圖推動，政院都不支持，竟也腦筋動到府方，尤其還試圖透過同學交誼，試圖影響蔡英文總統的核心幕僚，但府院太清楚，此案的爭議太大，並沒有改變立場。
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