最近二十年台灣高等教育政策搖擺不定、變幻莫測。十幾年前，教育部給予核定新設的大學研究所員額常不足五名，甚至不給名額，幾年後突然又宣布每個研究所至少要有五個員額，最弱勢的藝術類大學首當其衝，許多小研究所雞飛狗跳地忙著整併。
一九九四至二○○五年間教育部政策是廣設大學，希望高等教育走向普及化，全國大學數量因而暴增一倍，南藝大基本上也是「廣設大學」下的產物。孰料數年之後，教育政策大轉彎，也許真的是「朝令有錯，夕改又何妨？」教育部以國際競爭力及少子化考生人數減少為理由，推動大學院校整併，鎖定的對象不限於辦學績效不彰、招生困難的公私立大學，也包括幾所聲譽卓著的研究型大學。
二〇一一年初立法院通過大學法第七條修正案，賦予教育部對大專院校整併規劃與主導權限，二〇一二年六月二十二日並訂定「國立大學合併推動辦法」，給予教育部主導國立大學合併事宜，有了這個尚方寶劍，教育部更積極尋求併校的對象。
台灣的大學整併案其實早在一九九○年代末就陸續展開了，當時在教育部的鼓勵下，大學自行尋求對象。台灣師範大學與台灣科技大學的婚約曾經談得轟轟烈烈，最後良緣破碎，並不令人意外，光是兩校合併後的校名叫什麼？彼此爭議不休，總不會是（李）師科大學吧！
教育部現階段計畫整併的學校，有兩校旗鼓相當者，有大校吃小校者，也有小校希望併入大校者，如台南護專渴望嫁入成大這個豪門。教育部從廣設大學到要求大學整併，如以鋸箭法視之，皆不難明瞭當時的教育環境，以及非得如此不可的理由。然而，前後政策扞格，讓許多大學無所適從，很難想像三十年間的教育部是同一個國家的教育部。
台灣談合併的學校不少，「成功」的例證大致就是嘉義大學（嘉義師院＋嘉義農專）、東華大學併吞花蓮師範學院，仍在研議的學校則像參加婚友社一樣，這個配對不成，尋找下一個對象。清華與交大整併不成，轉與附近的竹教大尋求聯姻，台大與北教大的合併案從上世紀談到本世紀，可算是世紀之戀了。
在台灣三所藝術大學中，教育部選定南藝大為目標，大概是看上它遠在南部鄉下，人丁單薄、無權無勢，非與成大合併，不足以圖生存。教育部的顧慮果真如此，當初為補償競逐中正大學設校失利的台南縣，在官田鄉間創設國立台南藝術學院，便明顯是個美麗的錯誤了。南藝大果真走到被併校的命運，追根究柢，可以說成也教育部、敗也教育部。
南藝大有充滿江南風光的校園，以及創作力、展演力旺盛的老師、學生與校友，近年來自教育部的經費緊縮，教師員額不足，圖書設備短缺，嚴重影響教學品質。其實，高等藝術教育的困境，不只發生在南藝大，北藝大與台藝大也莫不如此，而三所藝術大學之所以經費困難，多半因為教育部對專業藝術高等教育觀念偏差所致，以為藝大可跟台大、清大、交大一樣，向企業、校友募款。
