申請程序為申請者遞出企劃書後，天使計畫會在1周內進行書面審查，如果資格不符將被退件，如果是資料不明確會要求補件，而通過文件書面審查後，天使計畫會通知申請者參加審議委員會，每個申請者有10分鐘的簡報時間，須明確說明自己的企劃案；之後會在6至8周內通知申請者是否通過審查，如果是附帶條件通過，則會再請申請者修正計畫。
2. 計畫書格式自由，未訂KPI
「大家在講天使難不難？我個人都說，很難！」身為創業天使計畫主持人的賴荃賢這麼說。他說，假如一般的創業補助或貸款是「著色比賽」，那創業天使計畫就像是一張空白紙，不像大部份創業補助限制了固定的格式，天使計畫書僅規劃目標、內容、資金運用、風險評估及預期效益等大方向及架構，讓創業者自由發揮，目的是不想用框框綁住創業者的創意，不過近來也逐漸看得出顧問代寫企劃案的痕跡。
曾申請過北市產發局補助及天使計畫的瑞德科技創辦人林筱玫便說，天使企劃書的格式較寬鬆，當初花了4個月完成，而台北市產發局企劃書則較規定較嚴格、較難寫，即使已有申請天使的經驗再申請，也花了半年才完成。
此外，由於天使計畫的性質介於補助及投資間，因此並未設定KPI（關鍵績效指標），不要求申請者一定要達到特定的成果才能核銷，也不須期中期末審查，不過賴荃賢坦言，「這麼寬鬆的資金未來要審計時將遇到嚴格的挑戰」。
3. 評審成員與業界接軌
對於引發爭議的評審標準、黑箱問題，賴荃賢表示，國發創業天使基金評審機制也有許多創新，不同於許多政府補助案及科專都用學者、官員作為評審代表，天使第一代的評審委員中就完全沒有官員，只有一點點的學者及許多產業代表；而第二代評審委員更加入了年輕創業家、創投等，目的就是要更貼近實際創業圈需求。
他說，天使評審委員有5到7位，其中一半為「一般委員」，另一半為「專業委員」，一般委員負責審查整個公司管理、營運模式、財務規劃，專業委員則看產品在專業領域有沒有發展性及市場；評審採合議共識決，需過半同意才會通過補助案。
對此，過去曾任品牌顧問、申請過無數補助計畫的北歐水果動物園創辦人方苡銨表示，天使評審委員中幾乎都由實際業界或者創投界人士組成，即使對撰寫過無數企劃書的她來說也是「震撼教育」。方苡銨認為，大部分的創業者帶有一點「夢想家」的特質，非常有理想，但往往較缺乏對現實的構想，這時創投人士會從現實角度切入，詢問創業者如何賺錢、營收、商業模式等實際營運層面的問題，就能打醒創業者，讓創業從理想逐漸化為真實。
