論文抄襲案經檢舉而爆發，從臺大作出確認抄襲並撤銷學位之決定，到被檢舉人最終宣布棄選桃園市長；即便中華大學尚未作出決定，全案似已接近尾聲。然而這場歷時月餘的論文風波，不單僅是選戰中的一場戰鬥而已，它更是臺灣民主體制未曾茁壯成熟即已積重難返的病症表現。究其病因，至少有以下三項。
首先，提及論文事件，最常見的一種病因分析是文憑形式主義，宣稱臺灣社會普遍過於迷戀文憑，才導致假留學洗學歷，假進修買文憑，乃至論文抄襲等事件頻傳。基此分析，解決之道應是改正或甚至放棄文憑形式主義。這種「文憑有害論」或「文憑無用論」的說法甚至外延擴散到教改領域，認為文憑掛帥也造就令多數人討厭的明星學校與導致考試主導教學。事實上，文憑與證照等形式憑證是降低交易成本，促進效率與提升安全的資訊揭露工具。否認它們存在的必要性與價值，根本違逆現代社會必然高度專業分工的發展趨勢。
其實問題並不在文憑或證照，也不在升學主義或明星學校。哪一個現代文明社會可以不需文憑或證照？不用說到人，單單就我們所食所用之物，從組成成分標示，有機憑證，檢驗證明，產地履歷到節能或安全標章等資訊揭露，都是為了改善生產者與消費者間的資訊不對稱。同樣的，選民與候選人間也存在嚴重的資訊不對稱問題，當然需要文憑與證照等形式憑證以改善此問題；故問題不在形式憑證本身。那問題在哪裡？
如果候選人皆有良好的文憑或證照，何必洗文憑或買證照？真正的問題是：一流人才或菁英不願從政，多數候選人是二、三流人才，或根本不是人才；不論是黑道透過學歷漂白，還是庸才透過文憑升級而假扮菁英，才是論文抄襲案的真正病因。換言之，我國民主選舉已因劣幣驅除良幣而不斷沉淪，需要學歷漂白或文憑升級美化的候選人俯拾即是。庸才充斥政壇與執掌國家權柄既是我國民主致命的病因，也是論文案的真正根源之一。
其次，高等教育供需市場嚴重失衡，導致各大學為了存續而飢不擇食。不僅在職專班或各種進修班次林立，連大學錄取率在幾近百分之百的情況下，都還有上萬名缺額。不論是碩士班或學士班，校方都是「只怕不來考」，而學生們則率皆「不怕考不上」。在此情況下，高等教育如何維持其應有之專業要求？然則，市場失衡僅是結果，其原因是「狂設大學」。而對於狂設大學如此明顯荒謬的錯誤政策，政客提倡，選民買單；沒有一個政黨或政客因此錯誤而被課責。選民無知且短視近利，政客無能且不負責任，這是我國這種既膚淺又致命之民主運作的最佳寫照，同時也是此論文案的另一根源。 （相關報導： 風評：林智堅論文案引爆能說和不能說的「秘密」 ｜ 更多文章 ）
最後，「政學兩棲」成為另一個眾人批判的焦點；其實這種關注也是見樹不見林。真正的問題是政治全面滲透學術，政治直接主導或建構學術，學界完全失去其應有的自主性與獨立性。有的人在學界與政界之間來去自如，時而學者，時而高官。有的人身在政界卻能號令學界，官大學問大；一旦掌握公權力與國家資源，學者對其皆得卑躬屈膝；或至少對其惡行以學術中立為名，視若無睹，靜默不語。有的人身在學界，卻以政治支撐作為其之所以能在學界飛黃騰達的唯一本錢，然後與政界遙相呼應。時而以學術菁英的地位指點江山，主導政策方向；時而以社會良心的身份捍衛特定政黨或政客之私利。
